当生效判决认定的事实与查明的事实不符时，这确实是一个需要严肃对待的法律问题。针对这种情况，法院会根据不同的情形和法律规定，采取相应的处理措施。以下是我为您详细梳理的法院可能的判决处理方式：
一、上诉途径
适用情形：
- 如果当事人对一审判决认定的事实不服，可以在法定期限内（通常为判决书送达之日起15日内）向上一级人民法院提起上诉。
法律依据：
- 根据《民事诉讼法》第171条和《刑事诉讼法》第236条的规定，第二审法院应对上诉案件进行全面审查，这包括事实认定和法律适用。
关键要点：
- 上诉时，当事人需要提交新证据或证明原认定事实错误的材料。
- 二审法院在审查后，可以依法改判、撤销原判或发回重审。
二、申请再审
适用情形：
- 判决生效后，如果当事人发现新证据足以推翻原判决，或者原判决存在重大错误，可以申请再审。
法律依据：
- 《民事诉讼法》第207条和《刑事诉讼法》第253条明确规定了再审的条件，包括“有新的证据，足以推翻原判决”等情形。
关键要点：
- 申请再审需要在法定期限内提出（民事为6个月，刑事为刑罚执行完毕后2年内）。
- 当事人需要提交充分证据证明原判决错误。
三、审判监督程序
法院依职权启动：
- 如果法院院长发现本院判决确有错误，或者上级法院认为下级法院判决错误，可以依职权启动审判监督程序。
- 法律依据：《民事诉讼法》第205条和《刑事诉讼法》第254条规定，法院可决定再审并中止原判决执行。
检察院抗诉：
- 如果检察院认为判决存在错误，损害国家利益、社会公共利益或当事人合法权益，可以提出抗诉。
- 法律依据：《民事诉讼法》第211条和《刑事诉讼法》第254条赋予检察院抗诉权。
- 检察院需通过调查核实后提出抗诉，法院必须启动再审程序。
四、其他救济措施
提出异议或申诉：
- 在判决生效前，如果当事人发现事实错误，可以向原审法院提出异议。
- 判决生效后，当事人也可以通过信访等途径申诉。
- 虽然无直接法律规定，但司法实践中法院会受理合理异议并进行审查。
执行监督：
- 如果判决进入执行阶段后发现事实错误，当事人可以申请执行监督。
- 法律依据：《最高人民法院关于人民法院办理执行异议和复议案件若干问题的规定》允许对执行依据提出异议。
- 当事人需要证明执行内容与事实严重不符，可能影响公正执行。
五、注意事项
- 时效限制：上诉、再审均有严格期限要求，逾期可能导致权利丧失。
- 证据规则：当事人需要提供合法有效的证据，如书证、物证、视听资料等，且需符合法定形式。
- 程序选择：根据案件性质（民事/刑事）、错误类型及证据情况选择最优救济路径。
- 专业辅助：建议当事人委托律师代理，以确保程序合规并提高纠错成功率。
综上所述，当生效判决认定的事实与查明的事实不符时，当事人可以通过上诉、申请再审、审判监督程序以及其他救济措施来维护自己的合法权益。在处理这类问题时，请务必注意时效限制、证据规则和程序选择等关键要点，并考虑寻求专业律师的帮助。