当有限公司的债务超过其注册资本时，追偿问题确实需要依据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规来综合考量。以下是我为您提供的详细解答：
一、公司责任
公司作为企业法人，拥有独立的法人财产权，这意味着公司需以其全部财产（包括但不限于流动资产、固定资产、无形资产等）来承担债务责任。这一责任并不局限于注册资本的范围内，而是涵盖了公司的所有可用资产。因此，即使债务超过了注册资本，公司仍有义务用其全部财产来清偿债务。
二、股东责任
一般情况：
- 在有限责任公司中，股东的责任通常限于其认缴的出资额。如果股东已经足额缴纳了出资，那么他们通常不需要用个人其他财产来偿还超出注册资本的公司债务。
特殊情况：
- 出资不足或抽逃出资：如果股东存在未按时足额缴纳出资、虚假出资或抽逃出资等行为，他们需要在未出资或抽逃出资本息的范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任。
- 法人人格否认：如果股东滥用了公司法人独立地位和股东有限责任来逃避债务，严重损害了债权人的利益，那么他们需要对公司债务承担连带责任。这通常发生在股东个人财产与公司财产混同，导致公司失去了独立财产基础的情况下。
三、法律程序与追偿方式
债权人主张债权：
- 债权人首先应向公司主张债权，要求公司用其全部财产来清偿债务。
申请破产清算：
- 如果公司资不抵债，无法清偿到期债务，且资产不足以清偿全部债务或明显缺乏清偿能力，债权人可以向人民法院提出破产清算申请。在破产清算程序中，公司的全部资产将被评估、变卖，并按法定清偿顺序进行分配。
追究股东责任：
- 在破产清算或债务追偿过程中，如果发现股东存在违法行为（如出资不足、抽逃出资或滥用公司法人地位等），债权人可以依法追究其责任，要求其在相应范围内承担补充清偿责任或连带责任。
四、建议与注意事项
加强财务管理：
- 公司应加强财务管理和风险控制，确保资产和负债的平衡，避免债务超出注册资本的情况发生。
及时补充资金：
- 如果公司出现资金短缺导致债务问题，应尽快采取措施补充资金，如通过融资、出售资产等方式来减轻债务压力。
寻求法律帮助：
- 在处理超过注册资本的债务问题时，公司、股东及债权人均应寻求专业法律人士的帮助。法律专业人士可以提供详细的法律咨询和解决方案，确保各方权益得到最大保障。
综上所述，当有限公司的债务超过其注册资本时，追偿问题需要综合考虑公司责任、股东责任以及法律程序等多个方面。通过加强财务管理、及时补充资金以及寻求法律帮助等措施，可以有效应对和解决这一问题。