双方签协议签名并按手印，是具有法律效应的。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，在合同上签字或按手印，都是表明合同当事人对合同内容认可并愿意受其约束的行为，具有同等的法律效力。因此，双方在协议上签名并按手印，完全符合法律规定的合同成立要件。
二、有效性条件
要使签名并按手印的协议具有法律效力，还需满足以下条件：
行为人具有相应的民事行为能力：
- 签订协议的双方或多方必须具备完全民事行为能力，能够独立进行民事活动并承担民事责任。例如，未成年人或精神病人等不具备完全民事行为能力的人签订的协议，其效力可能存在问题，除非是纯获利益的合同或者与其年龄、智力、精神健康状况相适应而订立的。
意思表示真实：
- 协议的内容必须是双方或多方的真实意愿表达，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方通过不正当手段迫使对方签订协议，如欺骗、威胁等，该协议可能被撤销或认定无效。
内容合法且不违背公序良俗：
- 协议的条款不能违反国家法律法规的强制性规定，也不得损害社会公共利益、违背社会公德或他人的合法权益。例如，以违法犯罪为内容的协议，或明显不公平、损害弱势群体利益且违背道德伦理的协议，均不具有法律效力。
三、特殊情况说明
存在瑕疵或争议时的处理：
- 如果协议存在笔误、歧义或其他可能导致误解的情况，双方应协商解决；协商不成的，可寻求法律途径解决。例如，可以通过诉讼或仲裁等方式，由法院或仲裁机构对协议内容进行解释或裁决。
- 若一方主张协议无效或可撤销，需提供充分证据证明存在法定无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫等）。否则，法院或仲裁机构将认定协议有效，并要求双方履行协议义务。
与其他证据的结合使用：
- 签名并按手印的协议是证明双方权利义务关系的重要证据，但并非唯一证据。法院在审理案件时，会结合其他相关证据（如履行情况、交易习惯等）进行综合判断。因此，在签订协议时，建议双方保留好与协议相关的其他证据，如转账记录、聊天记录等，以便在发生争议时提供有力支持。
四、实际建议
仔细阅读协议条款：
- 在签订协议前，双方应仔细阅读协议条款，确保内容符合自身意愿且合法有效。如有疑问或不明之处，应及时向对方或专业人士咨询。
保留好协议原件：
- 签订协议后，双方应妥善保管好协议原件，避免丢失或损坏。如需复印或扫描协议，应确保复印件或扫描件与原件一致，并妥善保存。
及时履行协议义务：
- 双方应按照协议约定的时间和方式履行各自的义务。如因特殊情况无法按时履行义务，应及时与对方沟通并协商解决方案。
总之，双方签协议签名并按手印是具有法律效应的。但为了确保协议的合法有效性和避免潜在纠纷，建议双方在签订协议前仔细阅读条款、保留好协议原件，并及时履行协议义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。