盗窃案件中使用的车辆是否归还当事人，需根据车辆的性质、来源及案件具体情况综合判断，以下分情况说明：

1. 车辆属于犯罪工具的情形

若车辆是专门为实施盗窃而准备（如改装车辆用于运输赃物、遮挡车牌逃避追踪等），或车主明知他人用于盗窃仍提供车辆，则车辆可能被认定为犯罪工具。根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪工具应当予以没收，上缴国库。此时，车辆不会归还当事人，而是由司法机关依法处理。

法律依据：
《中华人民共和国刑法》第六十四条：犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。

2. 车辆属于合法财产的情形

若车辆是当事人合法所有，且与盗窃行为无直接关联（如当事人日常使用的私家车，仅因偶然原因被用于盗窃），则车辆可能不会被没收。但需注意以下情况：

• 车辆被扣押期间：司法机关为调查取证可能暂时扣押车辆，待案件审结后，若车辆与犯罪无关，会依法返还。
• 车辆被用于运输赃物：若车辆仅临时用于运输赃物，且车主不知情或无过错，车辆可能不会被没收，但需配合调查。

法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百四十五条：对查封、扣押的财物、文件、邮件、电报或者冻结的存款、汇款、债券、股票、基金份额等财产，经查明确实与案件无关的，应当在三日以内解除查封、扣押、冻结，予以退还。

3. 车辆涉及其他违法行为的情形

若车辆本身存在其他违法行为（如套牌、走私、抵押纠纷等），司法机关可能将车辆移交相关部门处理，或要求当事人先行解决其他法律问题后再处理返还事宜。

4. 实务中的关键点

• 车主是否知情：若车主明知他人用于盗窃仍提供车辆，可能构成共犯，车辆被没收的风险极高。
• 车辆与犯罪的关联性：司法机关会综合车辆用途、使用频率、车主主观意图等因素判断是否没收。
• 程序合法性：若车辆被扣押或没收，当事人有权要求司法机关出具相关法律文书，并可依法申请复议或提起诉讼。

建议

1. 配合调查：若车辆被扣押，当事人应积极配合司法机关调查，提供车辆合法来源的证明（如购车发票、行驶证等）。
2. 咨询律师：若对车辆处理有异议，可委托律师介入，通过法律途径维护权益。
3. 保留证据：若车辆与犯罪无关，需保留相关证据（如监控录像、证人证言等）证明车辆未用于犯罪。

总结：盗窃案件中使用的车辆是否归还，需根据车辆是否属于犯罪工具、车主是否知情、车辆与犯罪的关联性等因素综合判断。若车辆被认定为犯罪工具，通常会被没收；若与犯罪无关，则可能返还。具体案件需结合证据和法律程序分析，建议当事人及时咨询专业律师。