结论：公司法定代表人以个人名义出借款项，但该款项实际由公司支付给借款人，此情形在法律上可能涉及多重法律关系与责任认定，需根据具体情况判断借款合同的效力、公司的责任以及法定代表人的法律责任。
一、借款合同主体的认定与效力
个人名义借款的认定：
- 若借款合同明确以法定代表人个人名义签订，且未体现公司作为借款方或担保方的任何表述，同时款项虽由公司支付，但无明确证据表明公司为实际借款人（如无公司盖章确认的借款协议、无公司内部决策程序文件等），则原则上应认定为法定代表人个人借款。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条及第六百六十七条，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同，合同效力原则上以合同文本及双方真实意思表示为准。
公司可能承担的责任：
- 若出借人能证明公司实际参与了借款行为（如公司直接支付款项至借款人账户，且该支付行为与公司业务相关，或有公司内部文件表明公司同意或授权法定代表人借款），则公司可能被视为共同借款人或实际借款人，需承担还款责任。
- 特殊情况：若出借人明知或应知款项实际为公司使用，仍与法定代表人签订个人借款合同，可能构成恶意串通，损害公司利益，合同可能被认定无效或部分无效，公司责任需根据具体情况判断。
二、公司的内部责任与追偿权
公司对法定代表人的追偿权：
- 若公司最终被认定为需承担还款责任，但款项实际由法定代表人个人使用或挪用，公司有权依据公司章程、内部管理制度或相关法律规定，向法定代表人追偿因此遭受的损失。
- 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，公司董事、高级管理人员执行公司职务时违反法律、行政法规或者公司章程的规定，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。
公司内部管理建议：
- 公司应建立健全财务管理制度，明确资金支付流程与审批权限，防止法定代表人擅自以公司资金对外借款或担保。
- 加强对法定代表人的监督与管理，定期审计公司财务状况，及时发现并纠正违规行为。
三、法定代表人的法律责任
民事责任：
- 若法定代表人以个人名义借款但款项实际用于公司，且未获得公司明确授权或同意，法定代表人可能需对公司承担民事赔偿责任，赔偿公司因还款而遭受的损失。
- 若法定代表人与出借人恶意串通，损害公司利益，法定代表人还需对出借人承担连带赔偿责任。
刑事责任：
- 若法定代表人利用职务便利，挪用公司资金归个人使用或借贷给他人，数额较大且超过三个月未还，或进行营利活动、非法活动，可能构成挪用资金罪，面临刑事处罚。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十二条，挪用资金罪的构成要件包括利用职务便利、挪用本单位资金、归个人使用或借贷给他人、数额较大且超过三个月未还等。
四、风险防范与建议
出借人层面：
- 详细审查借款合同，明确借款方为法定代表人个人还是公司，要求公司提供相关证明文件（如公司决议、授权委托书等）。
- 保留转账记录、借款合同等证据，以备日后纠纷之需。
公司层面：
- 加强内部管理，建立健全财务管理制度，防止资金被擅自挪用。
- 加强对法定代表人的监督与管理，定期审计公司财务状况。
法定代表人层面：
- 严格遵守法律法规与公司章程，不得擅自以公司资金对外借款或担保。
- 如需以公司名义借款，应获得公司明确授权，并按照公司规定流程办理。
总结：公司法定代表人以个人名义出借款项，但款项实际由公司支付给借款人，此情形在法律上较为复杂，需根据具体情况判断借款合同的效力、公司的责任以及法定代表人的法律责任。各方应严格遵守法律法规与公司章程，确保资金合法使用，并采取有效措施防范相关风险。如有具体法律问题，可直接向我咨询。