结论：在伤残因伤情复杂无法进行伤残等级鉴定，但残联已评定为三级残疾的情况下，法院判决伤残赔偿会综合多方面因素，可能存在以下几种处理方式。

1. 以残联评定结果作为参考依据
   • 残联作为专门负责残疾人事务的机构，其评定三级残疾具有一定的专业性和权威性。法院在审理案件时，可能会将残联的评定结果作为一个重要的参考因素。如果残联的评定程序合法、依据充分，且与案件中伤者的实际伤情相符，法院有可能会认可该评定结果，并据此确定伤残赔偿的等级和数额。
   • 例如，在一些交通事故导致伤残的案件中，由于伤者伤情复杂，司法鉴定机构暂时无法出具准确的伤残等级鉴定报告，而残联已经根据伤者的身体功能障碍情况评定为三级残疾。法院在综合审查相关证据，包括医疗记录、残联评定过程和依据等后，认为残联评定合理，就会按照三级残疾对应的赔偿标准来判决伤残赔偿。
2. 要求重新进行司法鉴定
   • 虽然残联评定了三级残疾，但司法鉴定和残联评定在目的、标准和程序上可能存在差异。司法鉴定更侧重于从法律和医学的角度，对伤者的伤残程度进行客观、准确的评估，以确定其在法律上应获得的赔偿。因此，法院可能会认为残联的评定结果不能直接作为判决伤残赔偿的依据，而要求伤者重新进行司法鉴定。
   • 比如，在一些工伤赔偿案件中，残联评定了残疾等级，但用人单位对残联评定结果有异议，认为该评定没有充分考虑伤者工作相关的身体功能受损情况。法院为了确保赔偿的公正性和准确性，会要求伤者到指定的司法鉴定机构重新进行伤残等级鉴定，然后根据新的鉴定结果来判决伤残赔偿。
3. 综合其他证据进行判断
   • 如果既无法以残联评定结果直接判决，又因各种原因无法重新进行司法鉴定，法院会综合其他相关证据来判断伤者的伤残程度和应获得的赔偿。这些证据可能包括医疗机构的诊断证明、治疗记录、康复情况、伤者的工作和生活能力受影响程度等。
   • 例如，伤者因伤情复杂无法进行伤残鉴定，残联评定为三级残疾，但法院在审查案件时发现，伤者虽然身体存在一定功能障碍，但经过一段时间的康复治疗，已经能够基本恢复正常的工作和生活。在这种情况下，法院可能会综合考虑这些因素，适当降低伤残赔偿的等级和数额，而不是直接按照残联评定的三级残疾标准进行判决。

建议：在这种情况下，伤者应积极收集和整理与自己伤情相关的各种证据，包括医疗资料、残联评定文件等，以支持自己的赔偿主张。同时，在诉讼过程中，要配合法院的工作，如需要重新鉴定应积极配合，以便法院能够全面、准确地了解伤者的实际情况，做出公正合理的判决。如果你还有其他关于伤残赔偿方面的疑问，可以直接向我咨询。