线索移送函及附件通常应装入程序卷，但具体还需根据案件实际情况和司法机关的具体要求来确定。以下是对这一问题的详细分析：

一、程序卷与证据卷的基本区分

1. 程序卷：主要记录案件办理过程中的程序性事项，如立案决定书、拘留证、逮捕证、取保候审决定书等法律文书的副本，以及案件办理过程中的各种审批手续、通知、送达回证等。它反映了案件办理的程序流程，是确保案件办理合法、合规的重要依据。

2. 证据卷：则主要收集、固定和保存与案件事实相关的证据材料，如物证、书证、证人证言、被害人陈述、犯罪嫌疑人供述和辩解、鉴定意见、勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录，以及视听资料、电子数据等。证据卷是证明案件事实、支持指控或辩护的关键材料。

二、线索移送函及附件的性质与归属

1. 线索移送函：通常是司法机关之间或司法机关与其他部门之间，为了协作办案、共享信息而移送案件线索的正式文件。它主要说明了线索的来源、基本情况、移送的原因和目的等，属于程序性文件。

2. 附件：作为线索移送函的补充材料，可能包括与线索相关的各种证据材料、调查报告、情况说明等。这些附件的内容可能既涉及程序性事项，也涉及实体性证据。然而，在大多数情况下，附件主要是为了支持线索的真实性和可靠性，因此更侧重于提供与案件事实相关的信息。

在归类时，如果附件主要是程序性的文件或说明，如审批手续、通知等，那么这些附件应随线索移送函一起装入程序卷。如果附件包含的是与案件事实直接相关的证据材料，如物证、书证等，且这些证据材料在后续案件办理中需要作为定案依据的，那么这些附件在移送时可能需要根据具体情况进行复制或另行装订成证据卷的一部分，但原件或主要副本通常仍应保留在移送机关的程序卷中，以备查证。不过，在实际操作中，为了简化流程和提高效率，许多司法机关会倾向于将线索移送函及其所有附件一并装入程序卷，并在需要时从程序卷中调取相关证据材料进行复印或摘录。

三、实际操作中的建议

1. 遵循司法机关的具体要求：不同司法机关在案件办理过程中可能有不同的规定和习惯做法。因此，在处理线索移送函及附件时，应首先了解并遵循接收机关的具体要求。

2. 保持文件的完整性和可追溯性：无论线索移送函及附件装入哪个卷宗，都应确保文件的完整性和可追溯性。这有助于在后续案件办理过程中快速找到所需文件，提高办案效率。

3. 及时沟通与确认：如果在处理过程中遇到任何疑问或不确定的情况，应及时与接收机关进行沟通并确认文件的归类和装订方式。

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