将人防工程全部做成储藏室是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、人防工程的性质与用途规定

人防工程，即人民防空工程，是指为保障战时人员与物资掩蔽、人民防空指挥、医疗救护等而单独修建的地下防护建筑，以及结合地面建筑修建的战时可用于防空的地下室。根据《中华人民共和国人民防空法》等相关法律法规，人防工程在平时应当兼顾人民防空需要，合理开发利用，但其战时功能不得改变。这意味着，人防工程在平时可以作为储藏室、车库等使用，但必须确保在战时能够迅速转换为防空设施，满足人民防空的需要。

二、合法性判断的关键因素

1. 规划与设计：

   • 人防工程的建设必须符合城市规划和人民防空规划的要求。
   • 在设计阶段，应明确人防工程的战时功能，并确保平时使用方式不影响其战时功能的实现。
   • 若规划与设计阶段已明确人防工程可兼作储藏室，且满足战时功能转换要求，则合法。

2. 使用与管理：

   • 人防工程的使用应遵守相关法律法规和规章制度，不得擅自改变其用途。
   • 若在使用过程中，未经批准将人防工程全部改为储藏室，且无法满足战时功能转换要求，则可能违法。
   • 管理单位应定期对人防工程进行检查和维护，确保其处于良好状态，随时可投入战时使用。

3. 审批与备案：

   • 任何对人防工程的改造或使用方式的变更，都应经过相关部门的审批和备案。
   • 未经审批擅自改变人防工程用途的，将面临法律责任。

三、可能面临的法律后果

• 若未经批准将人防工程全部改为储藏室，且无法满足战时功能转换要求，可能面临行政处罚，包括罚款、责令限期改正等。
• 在严重情况下，如因此导致人防工程在战时无法发挥应有作用，相关责任人还可能承担刑事责任。

四、建议与措施

1. 在改造或使用人防工程前，应咨询当地人民防空主管部门或专业律师，了解相关法律法规和政策要求。
2. 确保改造或使用方案符合规划与设计要求，不影响人防工程的战时功能。
3. 及时办理相关审批和备案手续，确保合法合规使用人防工程。

总结来说，将人防工程全部做成储藏室是否合法，取决于规划与设计、使用与管理以及审批与备案等多个因素。若您有人防工程改造或使用方面的法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。