判决书中明确要求追缴并上缴国库的赃款，一般情况下不能申请退还。以下从不同角度为你详细分析：

1. 法律性质角度

根据我国《刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。

这里的追缴上缴国库的赃款，本质上是国家对犯罪分子违法所得的强制收缴，目的是剥夺犯罪分子的非法利益，维护社会公平正义和经济秩序。一旦赃款被依法追缴并上缴国库，就成为了国家财产的一部分，不再属于原所有人（犯罪分子）或相关个人，因此通常不具备退还的法律基础。

1. 特殊情形角度

虽然一般情况下不能申请退还，但也存在一些特殊情形。例如，如果发现追缴上缴国库的赃款存在错误，比如将不属于违法所得的财物误追缴上缴，或者追缴过程中存在程序违法等情况，相关权利人可以通过法律途径主张权利，要求纠正错误并退还相应财物。

另外，如果犯罪分子在追缴前已经对部分赃款进行了合法处分，比如将部分赃款用于偿还合法债务等，且该处分行为得到了法律的认可，那么这部分财物可能不会被追缴上缴国库，也就不存在退还的问题。但这种情况需要严格的法律程序和证据支持。

1. 申请流程与难度角度

如果认为存在上述特殊情形，想要申请退还追缴上缴国库的赃款，需要向作出判决的法院提出申请，并提供充分的证据证明自己的主张。法院会依法进行审查，并根据审查结果作出决定。然而，由于涉及国家财产的保护和司法判决的权威性，这类申请的审查标准通常较为严格，申请成功的难度较大。

建议：如果你认为自己的情况符合特殊情形的条件，想要申请退还追缴上缴国库的赃款，建议先咨询专业律师，了解具体的法律程序和证据要求，以便更好地维护自己的合法权益。如果你还有其他法律问题，欢迎直接向我咨询。