结论：合同到期员工还在治疗中，单位一般不可以单方面解除劳动合同。以下从不同角度进行详细分析：
法律背景与规定
《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动合同法》第四十二条，劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同：……（三）患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的；……。这意味着，在员工处于医疗期内时，用人单位不得单方面解除劳动合同。
- 同时，《劳动合同法》第四十五条规定，劳动合同期满，有本法第四十二条规定情形之一的，劳动合同应当续延至相应的情形消失时终止。因此，如果员工在合同到期时仍在治疗中，即处于医疗期内，劳动合同应自动续延至医疗期满。
医疗期的确定：
- 医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的具体长度根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，一般为三个月到二十四个月不等。
法律建议与操作
单位应遵守法律规定：
- 在员工合同到期且仍在治疗中的情况下，单位应遵守《劳动合同法》的相关规定，不得单方面解除劳动合同。单位应继续履行劳动合同，包括支付工资、提供社会保险等福利待遇，直至医疗期满。
员工应了解自身权益：
- 员工应了解自己在医疗期内的权益，包括劳动合同的自动续延、工资支付、社会保险等。如果单位违反规定单方面解除劳动合同，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求单位继续履行劳动合同或支付赔偿金。
双方可协商处理：
- 在特殊情况下，如员工病情严重且长期无法恢复工作能力，双方可协商处理劳动合同的终止或解除事宜。但协商应基于平等、自愿的原则，且不得违反法律法规的强制性规定。
可能的法律后果
单位违法解除劳动合同的后果：
- 如果单位在员工医疗期内单方面解除劳动合同，将构成违法解除。根据《劳动合同法》的相关规定，员工有权要求单位继续履行劳动合同或支付赔偿金。赔偿金的标准通常为经济补偿金的两倍。
员工维权途径：
- 员工在遭遇单位违法解除劳动合同时，可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会将依法审理案件，并作出裁决。如果员工对裁决结果不服，还可以向人民法院提起诉讼。
总结与进一步思考：在员工合同到期且仍在治疗中的情况下，单位应遵守法律法规的规定，不得单方面解除劳动合同。员工应了解自身权益，并在必要时采取法律手段维护自己的合法权益。如果双方对劳动合同的终止或解除事宜存在争议，建议通过协商或法律途径解决。如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。