要证明扣发工资不能超过三个月，可以从以下几个方面入手收集和提供证据：

1. 劳动合同与规章制度：

   • 首先，查阅你的劳动合同以及公司的规章制度，特别是关于工资支付、扣发工资的条件和期限的条款。如果合同或制度中明确规定了扣发工资的期限不得超过三个月，那么这就是最直接的证据。
   • 示例：假设劳动合同中明确写着：“因员工原因造成公司损失的，公司有权从员工工资中扣除相应赔偿，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除期限不得超过三个月。”这样的条款就是有力的证明。

2. 工资条与银行流水：

   • 保留好你的工资条和银行流水记录，这些可以显示你的工资发放情况，包括正常发放和扣发的情况。
   • 分析：通过对比工资条和银行流水，你可以清晰地看到扣发工资的起始时间和结束时间，从而证明扣发是否超过了三个月。

3. 公司通知或邮件：

   • 如果公司扣发工资时给你发送了通知或邮件，这些文件也是重要的证据。它们可能包含了扣发工资的原因、期限和金额等信息。
   • 建议：确保保存好这些通知或邮件的原件或复印件，以便在需要时提供。

4. 同事证言或录音录像：

   • 如果有同事也经历了类似的情况，或者你与公司就扣发工资问题进行了沟通并留下了录音录像，这些也可以作为辅助证据。
   • 注意：在收集同事证言时，要确保证言的真实性和可靠性；在录音录像时，要遵守法律法规，不得侵犯他人的合法权益。

5. 法律条文与司法解释：

   • 虽然具体的法律条文可能不会直接规定扣发工资的期限，但你可以引用相关法律法规中关于工资支付、劳动权益保护的原则性规定来支持你的观点。
   • 示例：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位不得无故克扣或者无故拖欠劳动者的工资。虽然这条没有直接规定扣发期限，但可以作为你主张权益的法律依据。

在收集和提供证据时，还需要注意以下几点：

• 证据的真实性：确保你提供的所有证据都是真实、可靠的，不得伪造或篡改。
• 证据的完整性：尽量提供完整的证据链，以证明你的主张。
• 及时收集证据：一旦发现公司扣发工资，应尽快收集相关证据，以免时间过长导致证据丢失或难以收集。

如果公司扣发工资超过三个月，你可以采取以下措施：

• 与公司协商：首先尝试与公司进行协商，要求公司补发工资并说明扣发工资的合法性和合理性。
• 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并处理。
• 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动监察部门的处理结果不能满足你的要求，你还可以向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。