医疗器械公司医疗出入库未记录的，可能面临行政处罚，情节严重的还可能涉及刑事处罚，具体需结合未记录的原因、情节及后果综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、行政处罚层面

1. 违反《医疗器械监督管理条例》
   根据《医疗器械监督管理条例》第八十九条，若医疗器械经营企业、使用单位未依照规定建立并执行医疗器械进货查验记录制度、销售记录制度，或未按规定建立出入库记录的，由负责药品监督管理的部门责令改正，给予警告；拒不改正的，处5000元以上2万元以下罚款；情节严重的，责令停业，直至吊销相关许可证。
   关键点：处罚需以“责令改正后拒不改正”为前提，若企业及时补录记录并整改，可能免于罚款。

2. 违反《医疗器械经营质量管理规范》
   若企业未按照《医疗器械经营质量管理规范》要求建立完整的出入库记录（如未记录产品名称、规格、数量、批号、有效期等信息），可能被认定为“未执行质量管理规范”，同样面临警告、罚款甚至停业整顿的处罚。

二、刑事处罚层面（极端情况）

若未记录出入库的行为与以下情形关联，可能触犯刑法：

1. 生产、销售伪劣产品罪
   若企业通过未记录出入库掩盖销售假冒伪劣医疗器械的行为，且销售金额达5万元以上，可能构成该罪，最高可处无期徒刑。
   
2. 妨害药品管理罪
   若未记录行为导致不符合标准的医疗器械流入市场，足以严重危害人体健康，可能构成该罪，处3年以下有期徒刑或拘役。
   提示：刑事处罚需以“主观故意”或“严重后果”为前提，单纯未记录出入库通常不直接构成犯罪。

三、其他法律风险

1. 民事赔偿风险
   若因未记录导致医疗器械来源不明、质量无法追溯，引发患者损害的，企业可能因未尽到安全保障义务而承担民事赔偿责任。
   
2. 信用惩戒
   未记录行为可能被纳入企业信用记录，影响后续招投标、政府采购等资格。

四、合规建议

1. 立即整改：补全出入库记录，确保信息完整、可追溯。
   
2. 完善制度：建立医疗器械采购、验收、储存、销售等全流程记录制度，并定期自查。
   
3. 培训员工：加强相关人员对《医疗器械监督管理条例》等法规的学习，避免因疏忽导致违法。

若您的企业涉及此类问题，可进一步向我说明具体情况（如未记录的原因、是否已整改等），我将为您提供更精准的法律分析。