关于调解书中逾期违约金的计算方式，这确实是一个需要细致考虑的问题。首先，我们要明确的是，逾期违约金的计算通常遵循合同中的具体约定，若合同中有明确条款，则应按照合同来执行。以下是对逾期违约金计算方式的详细解答：

一、合同中有明确约定的情况

1. 固定金额计算法：

   • 如果合同中明确规定了逾期违约的固定金额，比如每逾期一日需支付一定数额的违约金，那么就直接按照这个固定金额来计算。例如，合同中约定每逾期一日支付违约金100元，若逾期了10日，则应支付的违约金就是1000元。

2. 比例计算法：

   • 按逾期金额的比例：合同中可能会约定按照逾期金额的某个百分比来计算违约金。比如，每日按逾期金额的0.5%计算。若逾期付款金额为50万元，逾期20天，则违约金就是500000×0.5%×20=50000元。
   • 按合同总金额的比例：有些合同会规定以合同总金额为基数来计算违约金，如工程承包合同中可能约定逾期需按合同总金额的3%支付违约金。
   • 分阶段计算：还有部分合同会根据逾期的不同阶段采用不同的违约金比例或金额。比如，逾期1-10天为0.3%，11-30天为0.5%等。

二、合同中没有明确约定的情况

1. 法律法规有明确规定：

   • 在某些特定领域，如商品房买卖，法律法规可能对逾期违约金有明确规定。如果合同中没有约定，那么一般可以参照同地段同类房屋的租金标准来确定违约金数额。

2. 实际损失主张：

   • 如果既没有合同约定，也无法律法规的明确规定，那么受损方可以要求违约方赔偿因逾期造成的实际损失。这包括直接损失和可得利益损失。受损方需要提供充分的证据来证明这些损失的数额。

3. 参照金融机构标准：

   • 对于金融类合同，如借款合同，如果未约定逾期违约金的计算方式，那么可以参照中国人民银行规定的金融机构计收逾期贷款利息的标准来进行计算。这通常是在贷款利率水平上加收一定比例，但不得超过法定上限。

三、重要注意事项

1. 违约金调整：

   • 如果约定的违约金低于实际造成的损失，当事人可以请求人民法院或仲裁机构予以增加。相反，如果约定的违约金过高，超过了造成损失的30%，那么可能会被认定为过高并适当减少。

2. 诉讼时效：

   • 逾期违约金的计算时效期限通常是三年，从权利人知道或应当知道自己的权利受到损害之日起开始计算。

3. 合同性质与行业惯例：

   • 不同类型的合同以及不同行业可能存在特定的违约金计算惯例和标准。在计算时，应充分考虑这些因素，以确保计算的合理性和公正性。

综上所述，逾期违约金的计算是一个综合考虑多方面因素的过程。在实际操作中，应严格按照法律规定和合同约定进行计算，并确保计算结果的准确性和合理性。如果调解书中对逾期违约金有明确约定，就按照约定来执行；如果没有约定，就参照相关法律法规和行业惯例进行合理计算。