在民事调解书中确定违约金是一个需要细致考量与平衡的过程，它旨在确保合同的顺利履行，并合理分配违约责任。以下是对如何确定民事调解书中违约金的详细解答：
一、法律依据与原则
首先，违约金的确定需遵循《中华人民共和国民法典》的相关规定。根据民法典第五百八十五条，当事人有权约定一方违约时应支付的违约金数额或损失赔偿额的计算方法。在设定违约金时，应秉持公平原则和诚实信用原则，既要体现对违约行为的惩罚性，也要兼顾守约方的实际损失及合同的履行状况。
二、确定违约金的具体步骤
明确违约情形：
- 在调解书中，应详细列明哪些行为构成违约，如迟延履行、不完全履行或拒绝履行等，以便为违约金的计算提供明确依据。
评估实际损失：
- 守约方需提供证据证明因违约所遭受的实际损失，这包括直接损失（如货物损坏、资金占用利息）和间接损失（如预期利润丧失）。法院或调解机构会结合这些证据进行综合判断。
参考合同约定与行业惯例：
- 若原合同已约定了违约金标准，且该标准未明显偏离实际损失，通常会作为确定违约金的重要参考。同时，还需考察同类交易的行业惯例，以避免设定过高或过低的违约金。
协商调整机制：
- 根据民法典规定，若约定的违约金过分高于或低于实际损失，当事人可请求法院或仲裁机构予以调整。在调解过程中，应预留协商空间，确保违约金数额既具有威慑力又符合公平原则。
三、违约金数额的确定方式
固定金额：
- 双方可直接约定具体的违约金数额。这种方式简单明了，但可能难以完全适应实际损失的变化。
比例计算：
- 按合同标的额的百分比（如日万分之五）计算违约金。这种方式既能体现违约程度，又与合同价值挂钩。
分段累进：
- 针对逾期时间设置阶梯式违约金标准（如逾期1-30天按日千分之一，超过30天按日千分之三）。通过经济杠杆促使当事人及时履约。
四、注意事项
合理性审查：
- 法院或调解机构会对违约金数额进行合理性审查，以防止过高或过低的违约金损害一方利益。
可执行性考量：
- 违约金数额应兼顾债务人的偿付能力，避免因数额过高导致执行困难。
条款完备性：
- 调解书应明确违约金的支付方式、时间节点及争议解决途径，确保条款具备可操作性。
五、特殊情况处理
- 若调解书中未明确约定违约金的具体数额或计算方法，可参照民法典相关规定，即损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。
- 若对违约金计算有争议，可在法定期限内通过合理途径解决，如申请再审等，但需有充分证据和合理理由。
综上所述，确定民事调解书中的违约金是一个综合考量多种因素的过程。在设定违约金时，应遵循法律依据与原则，明确违约情形，评估实际损失，参考合同约定与行业惯例，并预留协商调整机制。同时，还需注意违约金的合理性审查、可执行性考量及条款完备性等问题。