医疗回扣主动上交后是否还会处罚，这主要取决于上交的时间节点、回扣的性质以及相关法律法规的具体规定。以下从不同角度为你详细分析：
主动上交的时间节点与处罚的关联
- 在调查前主动上交：如果医务人员在接受调查前，主动向相关部门（如医院纪检监察部门、卫生行政部门或司法机关）上交回扣，并如实说明情况，这通常被视为有自首情节或主动配合调查的表现。根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，对于自首的犯罪分子，可以从轻或者减轻处罚。其中，犯罪较轻的，可以免除处罚。因此，在这种情况下，医务人员可能会面临较轻的处罚，甚至有可能免除处罚。
- 在调查过程中或之后上交：如果医务人员在已经接受调查或已经被采取强制措施后，才上交回扣，虽然这仍然是一种配合调查的行为，但可能不再被视为自首。此时，处罚的轻重将更多地取决于回扣的数额、情节以及医务人员在案件中的具体作用等因素。
回扣的性质与处罚
- 商业贿赂：医疗回扣往往被视为商业贿赂的一种形式，即医务人员利用职务上的便利，索取或非法收受他人财物，为他人谋取利益。这种行为不仅违反了职业道德，也触犯了法律。根据《中华人民共和国刑法》第一百六十三条，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
- 情节轻微：如果回扣的数额较小，且情节轻微，没有造成严重的社会危害，那么医务人员可能会面临较轻的行政处罚，如警告、罚款、吊销执业证书等，而不一定面临刑事处罚。
相关法律法规与政策导向
- 法律法规：除了《中华人民共和国刑法》外，还有《中华人民共和国反不正当竞争法》、《中华人民共和国药品管理法》等相关法律法规对医疗回扣行为进行了规范。这些法律法规明确禁止医务人员收受回扣，并规定了相应的法律责任。
- 政策导向：近年来，国家加大了对医疗领域腐败行为的打击力度，出台了一系列政策措施来规范医务人员的行为。这些政策导向表明，国家对于医疗回扣等腐败行为是零容忍的，无论是否主动上交，都将依法进行严肃处理。
建议：
- 如果你或你身边的人涉及医疗回扣问题，我建议尽快主动向相关部门上交回扣，并如实说明情况，以争取从轻或减轻处罚。
- 同时，要积极配合相关部门的调查工作，提供必要的证据和信息，以证明自己的清白或减轻自己的责任。
- 如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。