主动投案后，司法机关会根据具体案情、投案时机、认罪态度等因素，依法决定是否从轻或减轻处罚，甚至可能不起诉或免除处罚。具体处理方式如下：

1. 刑事拘留或取保候审
   投案后，司法机关会首先对嫌疑人采取强制措施。若案件性质较轻（如初犯、偶犯、社会危害性小），或嫌疑人存在自首、立功等情节，可能直接取保候审；若案件重大或嫌疑人可能逃避侦查，则可能刑事拘留。

2. 侦查阶段：核实自首情节
   公安机关会重点调查投案是否构成“自首”（自动投案+如实供述）。若符合，会在《起诉意见书》中明确建议从宽处理，并随案移送相关证据（如到案经过、讯问笔录）。

3. 审查起诉阶段：检察院量刑建议
   检察院会结合自首情节、犯罪性质、社会危害性等因素，提出量刑建议。若嫌疑人认罪认罚，检察院可能建议从宽处罚（如减轻基准刑的30%以下）；若符合不起诉条件（如犯罪情节轻微），可能直接作出不起诉决定。

4. 审判阶段：法院最终裁决
   法院会独立审查自首情节的合法性、真实性。若认定自首成立，通常会在量刑时予以体现：

   • 一般自首：可减少基准刑的40%以下；
     
   • 犯罪较轻：可减少基准刑的40%以上或依法免除处罚。
     若投案后翻供或未如实供述，自首情节可能被否定。

关键提醒：

• 投案后需如实供述全部犯罪事实，否则可能丧失自首认定；
  
• 主动退赃、赔偿损失、取得谅解等行为，可进一步争取从宽处理；
  
• 具体处理需结合案情，建议投案前咨询律师，确保投案方式合法有效。
  

如有具体案件或疑问，可直接向我咨询，我会结合案情详细分析。