您好，关于农田种药材是否合法的问题，这主要取决于农田的类型以及种植药材的具体情况。

首先，我们需要明确农田的类型。在我国，农田主要分为一般农田和基本农田。基本农田是受到严格保护的，根据《基本农田保护条例》的相关规定，基本农田保护区经依法划定后，任何单位和个人不得改变或者占用，且禁止在基本农田保护区内进行建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动，同时也禁止占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼。因此，在基本农田上种植中草药是不被允许的。

而对于一般农田，情况则相对复杂一些。根据自然资源部的相关答复，种植药材的土地能否认定为耕地，主要取决于种植方式和种植周期。如果直接利用地表耕作层种植药材，且每年种植一季及以上，如按照“每年种植一季”耕种方式种植半夏、蒲公英、沙参、白术等多年生药材的土地，可以按耕地进行认定。然而，如果种植周期在一年以上（不含一年），如种植西洋参、三七等的土地，则按园地进行认定。这意味着，在一般农田上种植短期轮作的药材，且不影响农田的耕作层和种植结构，可能是被允许的；但如果种植长期的药材，或者种植方式对农田造成了破坏，那么就可能涉及到违法用地的问题。

此外，国家也高度重视中药材的产业发展，并在确保粮食安全的前提下，积极支持各地合理利用土地资源，优化种植布局，为中药材种植业的发展创造良好的政策环境和空间。但这并不意味着可以随意在农田上种植药材，而是需要在遵守相关法律法规和政策规定的前提下进行。

综上所述，农田种药材是否合法，需要根据农田的类型、种植药材的具体情况以及相关法律法规和政策规定来综合判断。如果您有具体的种植计划或疑问，建议您咨询当地的自然资源部门或农业农村部门，以获取更准确和详细的解答。