关于耕地种中草药是否合法的问题，这主要取决于种植的中草药类型以及种植方式，并且涉及到我国的土地分类和管理规定。

首先，从《基本农田保护条例》来看，基本农田是受到严格保护的，任何单位和个人不得改变或者占用基本农田用于非农业建设，这包括不得在基本农田内发展林果业和挖塘养鱼等。因此，如果中草药种植涉及到改变基本农田的用途或者破坏基本农田的耕作层，那么这样的种植行为是不被允许的。

然而，对于一般耕地而言，情况就有所不同。根据《国土空间调查、规划、用途管制用地用海分类指南(试行)》和《国土变更调查技术规程(2022年度适用)》的相关规定，对于直接利用地表耕作层种植的药材，其土地分类会根据种植方式和周期来确定。具体来说：

• 如果药材是按照“每年种植一季”的耕种方式种植的，如半夏、蒲公英、沙参、白术等多年生药材，那么这样的土地仍然会被认定为耕地。
• 如果药材的种植周期在一年以上（不含一年），如种植西洋参、三七等，那么这样的土地则会被认定为园地。

因此，在耕地上种植中草药，需要确保不违反基本农田的保护规定，并且根据药材的种植方式和周期来确定土地的分类。如果是按照每年种植一季的方式种植多年生药材，且没有破坏耕地的耕作层，那么这样的种植行为是合法的。但如果涉及到改变耕地用途或者破坏耕地耕作层，那么就需要谨慎对待，并咨询当地土地管理部门以获取准确的指导和帮助。