如果综合计算工时工作制的审批过期了而不及时办理续期，可能会面临以下后果：
违法用工风险：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位实行特殊工时制度（如综合计算工时工作制）需要经过劳动行政部门的审批。若审批过期未续，用人单位继续按照综合计算工时工作制安排劳动者工作，可能构成违法用工，面临劳动行政部门的处罚，如警告、罚款等。
劳动者权益受损及潜在纠纷：
- 审批过期后，若用人单位仍按综合计算工时制安排工作，但未经合法审批，劳动者可能主张加班费等权益。因为在此情况下，劳动者的工作时间可能不再受综合计算工时制的限制，而应按照标准工时制计算加班费。这可能导致用人单位面临劳动仲裁或诉讼，增加法律成本和声誉风险。
影响企业合规经营形象：
- 审批过期未续可能被视为企业管理不规范、不重视劳动者权益的表现，影响企业的合规经营形象。在日益重视企业社会责任和劳动者权益保护的今天，这可能对企业的长期发展产生不利影响。
针对以上后果，建议用人单位采取以下措施：
- 及时办理续期手续：在审批到期前，用人单位应提前准备相关材料，向劳动行政部门申请续期，确保综合计算工时工作制的合法性。
- 加强内部管理：建立健全工时管理制度，确保劳动者的工作时间符合法律法规要求。同时，加强与劳动者的沟通，明确告知劳动者的工作时间安排和加班费计算方式，避免潜在纠纷。
- 关注法律法规变化：及时关注劳动法律法规的变化，确保企业的用工行为符合最新要求。如有疑问或需要进一步了解相关法律法规，可直接向我咨询。
举例说明：
假设某企业实行综合计算工时工作制，审批有效期为一年。在审批到期前，企业未及时办理续期手续，但仍继续按照综合计算工时制安排劳动者工作。一段时间后，部分劳动者向劳动仲裁委员会提起仲裁，要求企业支付加班费。由于企业未能提供有效的审批文件，劳动仲裁委员会最终裁决企业支付劳动者相应的加班费。这一案例充分说明了审批过期未续可能带来的法律风险和后果。