结论：在不知道的情况下加工了注册的商标，是否违法需分情况讨论，主要取决于是否满足商标侵权的构成要件以及是否存在免责事由。

1. 商标侵权的构成要件

根据《中华人民共和国商标法》的相关规定，商标侵权通常要求满足以下几个要件：

• 存在有效的注册商标：即被加工的商标必须是已经注册且在有效期内的商标。
• 未经商标注册人许可：即加工者没有获得商标注册人的明确授权或许可。
• 在同一种商品或服务上使用与其注册商标相同的商标：即加工的商品或服务与注册商标所核定的商品或服务类别相同，且使用的商标与注册商标完全一致或基本无差别。

2. 不知情情况下的加工行为分析

• 若满足商标侵权构成要件：即使加工者声称不知情，但如果实际上满足了商标侵权的所有构成要件，那么该行为仍然可能构成商标侵权。在这种情况下，加工者可能需要承担停止侵权、赔偿损失等民事责任。然而，在不知情的情况下，加工者可能不构成故意侵权，这在量刑或赔偿数额上可能会有所考虑。
• 若存在免责事由：根据《中华人民共和国商标法》的相关规定，如果加工者能够证明其加工行为是基于善意且不知道所加工的是注册商标，并且能够提供合法来源（如从合法渠道购买原材料、接受合法委托等），那么在某些情况下可能免除或减轻其法律责任。但这一免责事由的适用需要严格满足法定条件，并需加工者承担举证责任。

3. 法律建议

• 加强商标意识：作为加工者，应增强商标意识，了解并遵守相关商标法律法规，避免在不知情的情况下侵犯他人商标权。
• 谨慎接受委托：在接受加工委托时，应要求委托方提供商标注册证书或相关授权文件，以确认所加工的商标是否合法有效。
• 保留证据：在加工过程中，应保留好相关证据（如原材料购买凭证、加工合同、委托方身份信息等），以便在发生纠纷时能够证明自己的善意和合法来源。
• 及时咨询律师：如果发现自己可能侵犯了他人商标权，应及时咨询专业律师，了解自己的法律责任和可能的免责事由，以便采取合适的应对措施。

4. 可能的法律后果

• 民事责任：如果构成商标侵权，加工者可能需要承担停止侵权、赔偿损失等民事责任。赔偿数额通常根据侵权行为的性质、情节以及商标注册人的实际损失等因素确定。
• 行政责任：在某些情况下，商标侵权行为还可能受到行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
• 刑事责任：如果侵权行为情节严重，构成犯罪的，加工者还可能面临刑事责任，如假冒注册商标罪等。但这一后果通常适用于故意且情节严重的侵权行为。

总结：在不知道的情况下加工了注册的商标是否违法，需根据具体情况判断。作为加工者，应增强商标意识，谨慎接受委托，并保留好相关证据。如果发现自己可能侵犯了他人商标权，应及时咨询专业律师以了解自己的法律责任和可能的免责事由。