单位机构改革合并后，原劳动合同继续有效，但若需重新签订或变更劳动合同，应由合并后的新单位与劳动者协商一致后进行签订或变更。以下是详细分析：
一、劳动合同的继续有效
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条的规定，用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。
- 实际操作：在单位机构改革合并的过程中，如果原劳动合同中的用人单位主体发生了变更，但劳动者的岗位、工作内容、劳动报酬等核心条款未发生变化，且新单位愿意承继原劳动合同的权利和义务，那么原劳动合同将继续有效，无需重新签订。
二、劳动合同的重新签订或变更
协商一致原则：如果因单位机构改革合并导致原劳动合同中的用人单位主体、岗位、工作内容、劳动报酬等核心条款需要变更，或者新单位要求与劳动者重新签订劳动合同，那么应当遵循协商一致的原则。即新单位应当与劳动者就变更或重新签订劳动合同的事宜进行充分协商，并达成一致意见。
签订或变更流程：
- 变更劳动合同：如果仅需变更原劳动合同的部分条款，如用人单位名称、法定代表人、主要负责人等，可以签订劳动合同变更协议，明确变更的内容和生效时间。
- 重新签订劳动合同：如果因合并导致原劳动合同无法继续履行，或者新单位要求与劳动者重新签订劳动合同，那么应当按照《中华人民共和国劳动合同法》的规定，与劳动者协商一致后重新签订劳动合同。重新签订的劳动合同应当明确双方的权利和义务，包括工作内容、工作地点、劳动报酬、社会保险等条款。
三、注意事项
- 保护劳动者权益：在单位机构改革合并的过程中，应当充分保护劳动者的合法权益。新单位不得以合并为由降低劳动者的劳动报酬、工作条件或者解除劳动合同。
- 及时沟通协商：单位机构改革合并涉及劳动者的切身利益，新单位应当及时与劳动者进行沟通协商，明确合并后的工作安排和劳动合同的签订或变更事宜。
- 遵守法律法规：在签订或变更劳动合同的过程中，新单位应当遵守相关法律法规的规定，确保劳动合同的合法性和有效性。