公务员病假扣工资是否合法，需根据病假时长和工作年限来确定，不能一概而论。以下是对此问题的详细分析：
病假在2个月以内（不含公休节假日）：
- 公务员的原工资照发，即工资收入不因病假而减少，按照正常出勤时的标准全额发放。因此，在这种情况下，扣工资是不合法的。
病假超过2个月但不足6个月：
- 工作年限10年及以下的公务员，从第3个月起，按本人标准工资的90%计发。这意味着工资会有所减少，但并非完全扣除，而是按照一定比例发放。
- 工作年限11年及以上的公务员，原工资照发，即依然按照正常的标准工资全额发放。在这种情况下，扣工资同样是不合法的。
病假超过6个月：
- 工作年限10年及以下的公务员，从第7个月起，按本人标准工资的70%计发。工资减少的比例更大，但并非完全扣除。
- 工作年限11-20年的公务员，从第7个月起，按本人标准工资的80%计发。
- 工作年限21年以上的公务员，从第7个月起，按本人标准工资的90%计发。
- 在这些情况下，虽然工资有所减少，但并非无依据的扣除，而是根据工作年限和病假时长来确定的合法调整。
特殊情况说明：
- 对于获得相关荣誉的人员，如1945年9月2日以前参加革命工作的人员，以及省、市、自治区人民政府和国务院各部门授予的劳动英雄、劳动模范等，其病假期间的工资待遇有特别规定，通常更为优厚。
- 长期病假人员，如果经过医院证明确定不能坚持正常工作，并经任免机关批准，可以办理退休（退职）手续，其工资待遇也会相应调整。
地区差异与咨询建议：
- 不同地区可能会根据当地实际情况，在国家规定的基础上出台一些具体的实施细则或补充规定。因此，在实际执行时，应以当地政策为准。
- 如果有任何疑问或需要具体了解本单位的相关规定，建议咨询所在单位的人事部门或财务部门，或者查阅相关的官方文件和政策解读。
总结与建议：
- 公务员病假期间的工资待遇并非一成不变，而是根据病假时长和工作年限来确定的。
- 在大多数情况下，公务员的基本工资不会完全扣除，而是按照一定比例发放或全额发放。
- 如果有任何关于病假工资待遇的疑问或争议，建议及时咨询所在单位的相关部门或专业律师（即我本人），以确保权益得到准确保障。
如有更多关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。