核心结论：怀孕员工因加班导致流产，能否申请工伤认定需结合具体情况判断，目前法律未直接将此类情形明确纳入工伤范围，但可通过以下两种途径主张权益：

1. 申请工伤认定的可能性及条件

根据《工伤保险条例》第十四条，工伤认定需满足“工作时间、工作场所内，因工作原因受到事故伤害”或“工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或收尾性工作受到事故伤害”等情形。
关键分析：

• 若加班行为本身存在违法性（如用人单位违反《劳动法》关于加班时长的限制，即每日加班不超过1小时、特殊情况不超过3小时、每月不超过36小时），且加班与流产存在直接因果关系（需医学证明），可能被认定为“工作原因”导致的伤害，从而符合工伤认定条件。
  
• 但实践中，工伤认定机构可能以“流产属于身体机能问题，非外力事故伤害”为由拒绝认定，此时需通过行政复议或诉讼主张权利。

2. 通过侵权责任主张赔偿的路径

若工伤认定未获支持，员工可依据《民法典》第一千一百六十五条，以用人单位存在过错（如强制加班、未提供劳动保护条件）为由，主张侵权损害赔偿。
关键分析：

• 需证明用人单位存在过错（如违反加班时长规定、未安排合理休息、未进行孕期健康检查等），且过错与流产存在因果关系（需医学鉴定）。
  
• 赔偿范围包括医疗费、误工费、护理费、精神损害抚慰金等，具体需结合证据和当地司法实践确定。

实务建议

1. 立即收集证据：包括加班记录（考勤表、聊天记录等）、医院诊断证明（明确流产与劳累的关联性）、用人单位违法加班的证据（如排班表、同事证言）。
   
2. 优先申请工伤认定：向当地社保部门提交申请，若被驳回，可在60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼。
   
3. 同步准备侵权诉讼：若工伤认定无果，可向法院起诉用人单位，主张侵权赔偿。
   

提示：此类案件需结合医学、劳动法、侵权法多领域知识，建议委托专业律师处理证据固定和法律程序。如有进一步问题，可直接向我咨询。