被起诉人在坐牢的情况下，诉讼程序仍会依法进行，其合法权益会得到充分保障。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、诉讼文书的送达与开庭安排
诉讼文书送达：
- 法院会按照法律规定的程序，将起诉书副本、传票等诉讼文书送达到监狱，由监狱负责转交给被起诉人。被起诉人在监狱工作人员见证下签收相关文书，了解起诉的具体内容和开庭时间等关键信息。
开庭安排：
- 监狱内开庭：对于简单、安全风险可控的案件，法院可以在监狱内设置临时法庭进行开庭审理。监狱提供合适的场地和安全保障措施，确保庭审活动的顺利进行。
- 押解至法院开庭：对于复杂、涉及重要证据或需要专业设备支持的案件，法院会与监狱协商安排将被起诉人押解至法院参加庭审。押解过程中，监狱和公安机关密切配合，确保被起诉人的人身安全和庭审秩序。
- 远程视频开庭：如被起诉人无法亲自出庭，可以向法院申请远程视频开庭等方式进行审理，以确保诉讼程序的顺利进行。
二、被起诉人的权利保障
辩护权：
- 被起诉人在监狱中仍然享有获得辩护的权利。可以自行委托律师为其辩护，也可以申请法律援助。律师可以前往监狱会见被起诉人，了解案件情况，提供法律咨询、收集证据、准备辩护策略等。
陈述和辩论权：
- 在庭审过程中，被起诉人有权就案件事实进行陈述，对对方的证据发表意见，进行辩论。法官会保障其充分行使这些权利，听取其辩解和诉求。
申诉权：
- 被起诉人如认为判决不公或有其他合法理由，享有申诉的权利。
三、判决执行与后续处理
判决执行：
- 如果被起诉人被判定有罪需要执行新的刑罚，会根据判决结果与原服刑情况进行相应的刑期合并计算或调整执行方式。
- 如果涉及民事赔偿等判决内容，监狱会协助相关部门监督被起诉人履行判决义务，如通过其在监狱内的劳动报酬等方式执行赔偿。
后续处理：
- 被起诉人应积极配合司法机关的工作，如实陈述案件事实，提供相关证据，以便法院作出公正判决。
- 如对判决结果有异议，被起诉人可以在法定期限内提出上诉或申诉，维护自己的合法权益。
四、特殊情况下的处理
若被起诉人因健康原因无法参与诉讼：
- 法院可能会根据具体情况决定中止诉讼或采取其他适当措施，如延期审理、指定法定代理人等，以确保诉讼程序的公正性和合法性。
若被起诉人涉及多个案件：
- 法院会协调各案件的审理进度，确保被起诉人能够充分参与每个案件的诉讼程序，并保障其合法权益不受损害。
总结与建议：
即使被起诉人在坐牢，也不会影响其参与诉讼程序和行使合法权利。法院和相关部门会依法保障其诉讼权益，确保司法公正和合法性。作为被起诉人，应充分利用自己的法律权利，积极参与诉讼过程，以维护自身的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和指导。