企业房屋在征收手续合法齐全的情况下拆迁，需要缴纳土地增值税和企业所得税，但存在相应的税收优惠或减免政策，具体需结合实际情况判断。以下从两个税种分别进行分析：
土地增值税
- 一般规定：根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》及其实施细则，转让国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物（即转让房地产）并取得收入的单位和个人，应当缴纳土地增值税。企业房屋被拆迁，通常可视为转让房地产的一种特殊形式（通过征收补偿实现产权转移），因此原则上需缴纳土地增值税。
- 税收优惠：若企业房屋拆迁属于“因城市实施规划、国家建设的需要而被政府批准征收的房产”，根据财税〔2006〕21号文件规定，可免征土地增值税。但需满足以下条件：
- 征收主体为县级以上人民政府；
- 征收目的为城市规划或国家建设需要（如旧城改造、公共设施建设等）；
- 企业需提供政府征收文件、补偿协议等证明材料。
企业所得税
- 一般规定：根据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例，企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，包括转让财产收入（如房屋拆迁补偿款），均需计入收入总额缴纳企业所得税。
- 税收优惠：若企业房屋拆迁符合政策性搬迁条件（如因政府城市规划、基础设施建设等公共利益需要），根据财税〔2009〕80号文件规定，企业可在搬迁完成年度（以搬迁协议规定的搬迁完成年限为准）将搬迁收入扣除搬迁支出后的余额计入应纳税所得额。若搬迁支出大于收入，可在5年内分期摊销扣除，从而减少当期税负。
实务建议
- 资料准备：企业需保留政府征收文件、补偿协议、资产评估报告等材料，以证明拆迁的合法性及补偿金额的合理性。
- 税务申报：在年度企业所得税汇算清缴时，需单独填报《政策性搬迁纳税调整明细表》，并附送搬迁协议、政府文件等证明材料。
- 政策咨询：由于税收政策可能因地区或时间调整，建议企业在拆迁前与主管税务机关沟通，确认具体税收处理方式。
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