结论前置：未经验收的工程被使用，将产生一系列严重的法律后果和经济风险，不仅可能面临行政处罚，还会影响工程质量的责任界定、工程价款的结算，甚至可能引发安全隐患和合同纠纷。以下是对这些后果的详细分析：
一、法律风险与行政处罚
行政处罚：
- 根据《建设工程质量管理条例》第五十八条，建设单位未组织竣工验收或验收不合格擅自交付使用的，将面临责令改正和罚款（工程合同价款百分之二至百分之四）的行政处罚。若造成损失，还需依法承担赔偿责任。
法律责任界定：
- 若建设单位擅自使用未经验收的工程，并随后以质量问题为由主张权利，法院将不予支持（但地基基础工程和主体结构质量问题除外）。这是因为擅自使用被视为对工程质量的认可，且难以界定质量问题产生的原因。
二、工程质量责任的影响
一般原则：
- 擅自使用未经验收的工程，建设单位将丧失对除地基基础工程和主体结构外的质量问题的追责权。这是因为这些部分的质量问题可能因使用而加剧或难以界定责任。
例外情况：
- 承包人对地基基础工程和主体结构在合理使用寿命内的质量仍需承担民事责任。这是因为这些部分是工程的核心，其质量直接关系到整体安全和正常使用。
三、工程价款结算的影响
价款结算原则：
- 建设单位擅自使用工程不影响工程价款的正常结算。只要施工单位完成了合同约定的工程内容，且工程质量不存在根本性影响使用的问题，施工单位有权按照合同约定要求支付工程款。
拒付风险：
- 若建设单位以未经验收为由拒付工程款，施工单位可通过法律途径维护权益，如提起诉讼或申请仲裁。
四、安全隐患与合同纠纷
安全隐患：
- 未经验收的工程可能存在结构不稳定、消防设施不完善等安全隐患，擅自使用将威胁人员生命和财产安全。一旦发生事故，建设单位将承担巨大的赔偿责任，甚至可能被追究刑事责任。
合同纠纷：
- 擅自使用未经验收的工程违反了建设单位与施工单位之间的合同约定，构成违约行为。双方可能因此产生争议并引发诉讼或仲裁，耗费大量时间和精力解决纠纷。
五、实际案例与启示
- 案例：某建设单位急于投产而擅自使用了部分未完全完工且未验收的厂房。随后，以墙面裂缝等非结构性质量问题为由拒付剩余工程款。法院最终判决建设单位不得以此为由拒付工程款，并需按合同约定支付剩余款项。
- 启示：建设单位应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保工程经过合格验收后再投入使用。擅自使用未经验收的工程不仅可能面临法律处罚和经济损失，还可能影响企业声誉和后续项目承接。
六、综合建议
- 严格遵守法律法规：建设单位、施工单位和监理单位应充分认识到擅自使用未经验收工程的严重性和危害性，严格遵守相关法律法规和工程建设程序。
- 加强沟通与协作：各方应加强沟通与协作，共同确保工程按期、按质完成验收工作。对于发现的质量问题，应及时沟通并要求整改。
- 寻求专业法律帮助：在遇到相关法律问题时，可直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，未经验收的工程被使用将产生多方面的严重后果。因此，各相关方应高度重视工程验收工作，确保项目合规、合法、安全地交付使用。