协议盖章后不签字，在通常情况下是有效的，但具体效力还需结合合同约定、盖章的有效性以及其他生效要件综合判断。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律依据与一般情形下的有效性

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，签字、盖章或按指印都是合同成立的有效方式，且三者具有同等的法律效力。因此，在协议上仅盖章而未签字的情况下，只要盖章行为符合法律规定，协议通常可以成立并生效。

二、影响协议效力的关键因素

1. 合同约定：

   • 如果协议中明确约定“盖章且签字后生效”等类似条款，那么仅盖章不签字的情况下，协议可能不生效。因为此时当事人对协议的生效附加了特定条件，即必须同时满足盖章和签字的要求。

2. 盖章的有效性：

   • 所盖印章必须是真实有效的，且盖章主体应是协议当事人或其授权代表。如果印章是伪造、变造的，或者盖章主体无权盖章（如盗用他人印章），那么协议的效力就会受到质疑，甚至可能被认定为无效。

3. 其他生效要件：

   • 除了签字或盖章外，协议的生效还可能受到其他要件的影响，如协议内容的合法性、双方当事人的真实意思表示、协议标的的确定与可能等。只有这些要件都具备，协议才能真正生效。

三、特殊情形下的效力认定

1. 表见代理：

   • 在某些情况下，即使协议上没有签字，但如果一方有理由相信另一方有权代表公司签订协议，并且基于这种信赖签订了协议，那么该协议可能构成表见代理，从而产生法律效力。

2. 实际履行情况：

   • 如果协议虽然没有签字，但双方已经按照协议约定实际履行了主要义务，且对方接受了履行，那么根据法律规定，该协议也可以成立并生效。

四、风险与注意事项

1. 核实身份与权限：

   • 在签订协议前，应仔细核实对方的身份信息和签约权限，确保对方具备签订协议的资格和能力。

2. 审查协议条款：

   • 认真审查协议条款，特别是关于签字、盖章等关键条款的约定，避免因为疏忽而引发不必要的纠纷。

3. 保留证据：

   • 在协议签订和履行过程中，注意保留相关证据，如协议文本、往来函件、付款凭证等，以便在发生纠纷时能够维护自己的合法权益。

五、操作建议

虽然从法律上讲，协议盖章不签字在多数情况下是有效的，但为了避免潜在的纠纷和风险，以及更规范地签订协议，建议在签订协议时既盖章又签字。这样做不仅可以增强协议的严肃性和可信度，还能为后续的协议履行和争议解决提供更有力的证据支持。

综上所述，协议盖章后不签字是否有效需综合考虑多种因素。在实际操作中，应谨慎对待协议签订过程中的每一个环节，确保协议的合法性和有效性。如果您在协议签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律意见和帮助。