在吸收合并中，如果被合并方持有长期股权投资（长投），处理方式需结合合并协议条款、会计准则及税法规定综合判断。以下是具体分析：

1. 合并协议中的权利义务承接条款
   根据《公司法》第174条，吸收合并后被合并方的债权债务由合并方承继。若被合并方的长投属于其资产范畴，合并方需在合并协议中明确约定该长投的处置方式：

   • 直接承接：合并方取得被合并方对子公司的股权，成为新股东，需按《企业会计准则第2号——长期股权投资》确认初始计量（通常以被合并方账面价值为基础）。
     
   • 处置转让：若合并协议约定合并前需处置长投（如出售给第三方），则需按《公司法》第71条履行股东优先购买权程序，并确认处置损益（影响合并成本或商誉）。
     
   • 剥离排除：若合并协议明确排除长投（如约定仅合并特定资产），则需通过资产分割或股权转让提前处理，避免合并后权属争议。

2. 会计处理的关键点

   • 同一控制下合并：若合并方与被合并方受同一方控制，长投按账面价值并入合并方报表，不确认损益（《企业会计准则第20号——企业合并》第6条）。
     
   • 非同一控制下合并：长投按公允价值计量，差额计入合并成本或商誉（《企业会计准则第20号——企业合并》第12条）。
     提示：需评估长投的公允价值（如子公司净资产份额、市场法估值），避免低估或高估影响合并报表真实性。

3. 税务合规风险

   • 企业所得税：若长投处置产生收益，需按《企业所得税法》第6条确认应税收入；若为亏损，需符合条件方可弥补（《企业所得税法》第18条）。
     
   • 印花税：股权转让合同需按“产权转移书据”缴纳0.05%印花税（《印花税法》附件《印花税税目税率表》）。
     
   • 特殊性税务处理：若符合条件（如股权支付比例≥85%），可申请递延纳税（《财政部、国家税务总局关于企业重组业务企业所得税处理若干问题的通知》第5条）。

4. 实务操作建议

   • 尽职调查：合并前核查被合并方长投的权属（如是否存在质押、冻结）、子公司财务状况（如或有负债），避免隐性风险。
     
   • 协议条款设计：明确长投处置时间表、价款支付方式、违约责任，例如约定“合并方有权在合并后6个月内处置长投，被合并方原股东承担处置损失”。
     
   • 过渡期安排：若长投处置需时间，可约定过渡期损益归属（如归被合并方原股东），避免合并后争议。

总结：吸收合并中被合并方的长投需通过协议约定处置方式，会计上按控制关系选择计量方法，税务上关注应税收入与递延政策，实务中需通过尽调与条款设计规避风险。如有具体案例或数据，可进一步分析优化方案。