结论前置：一般情况下，六月初辞职不能扣五月工资，用人单位扣发工资的行为可能涉嫌违法。下面我从不同角度为你详细分析：

从法律规定角度

根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，只要劳动者在五月提供了正常劳动，用人单位就有义务在约定的时间支付五月的工资，不能因为劳动者六月初辞职就扣发五月工资。

从实际情况角度

1. 正常辞职流程：如果劳动者按照用人单位规定的辞职流程，提前一定时间（如提前三十日以书面形式通知用人单位，在试用期内提前三日通知用人单位）提出辞职申请，并且在五月正常出勤、完成了工作任务，那么用人单位没有理由扣发五月工资。例如，小李在五月每天都按时上班，完成了公司安排的工作，六月初按照公司规定提前一个月提交了书面辞职申请，这种情况下公司扣发小李五月工资就是不合法的。
2. 存在特殊情况：如果劳动者在五月存在违反公司规章制度、给公司造成损失等情形，用人单位可以按照劳动合同的约定或者公司规章制度的规定，要求劳动者承担相应的赔偿责任。但是，用人单位扣发工资的数额不能超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。例如，小张在五月因工作失误给公司造成了5000元损失，小张当月工资为6000元，公司最多只能扣发1200元（6000×20%），并且扣除后小张当月工资不得低于当地最低工资标准。如果公司直接扣发小张五月全部工资，这种做法就是违法的。

从维权途径角度

如果用人单位扣发了劳动者五月工资，劳动者可以通过以下途径维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：劳动者可以先与用人单位进行沟通，说明自己的情况，要求用人单位支付被扣发的工资。在协商过程中，劳动者要注意保留好相关的证据，如工资条、劳动合同、工作记录等。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门会对用人单位的违法行为进行调查处理，并责令用人单位支付被扣发的工资。
3. 申请劳动仲裁：劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁时，劳动者需要提交仲裁申请书、相关证据等材料。劳动争议仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律规定，作出公正的裁决。

建议：如果你遇到了六月初辞职被扣五月工资的情况，可以先与用人单位友好协商，如果协商不成，及时收集相关证据，通过向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁等途径维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或者需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。