结论：公司非法侵占股东50万，若该行为构成职务侵占罪，则通常会被处以三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金。但具体判决会受到多种因素的影响，包括自首立功、退赃退赔、犯罪动机与手段等。
详细分析：
定罪依据：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规定，公司、企业或其他单位的工作人员，若利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，且数额较大，即构成职务侵占罪。在此案例中，若公司非法侵占股东50万，且该行为是由公司工作人员利用职务便利实施的，那么该行为就满足了职务侵占罪的构成要件。
量刑标准：
- 数额标准：依据相关司法解释，职务侵占罪中的“数额较大”起点为6万元，“数额巨大”起点为100万元。因此，职务侵占50万属于“数额较大”的范畴。
- 刑罚标准：根据《刑法》第二百七十一条，犯职务侵占罪，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金。这意味着，职务侵占50万的行为，通常会在这一刑罚幅度内量刑。
影响量刑的其他因素：
- 自首与立功：若犯罪嫌疑人在案发后主动投案自首，或提供重要线索协助侦破其他案件，根据法律规定，可以从轻或减轻处罚。
- 退赃退赔：犯罪嫌疑人在案发后积极退赃退赔，能够挽回单位部分或全部损失的，法院在量刑时通常会酌情从轻处罚。这一行为体现了犯罪嫌疑人的悔罪态度和对损害结果的弥补努力。
- 犯罪动机与手段：犯罪动机的卑劣程度、犯罪手段的复杂性和恶劣性等因素，也会对量刑产生重要影响。例如，通过精心策划、伪造单据等手段进行职务侵占的，相较于简单直接的侵占行为，可能会受到更重的刑罚。
特殊情况考虑：
- 如果侵占行为并非由公司工作人员利用职务便利实施，或者该行为涉及其他犯罪构成要件（如诈骗、盗窃等），则可能构成其他犯罪，量刑标准也会有所不同。
- 另外，如果公司本身并非独立承担刑事责任的主体（如一人有限责任公司或个人独资企业等），则可能需要追究实际控制人或个人的刑事责任。
建议与行动：
- 对于股东而言，若发现公司非法侵占其财产，应立即收集相关证据（如转账记录、合同、公司决议等），并向公安机关报案。
- 在报案前，股东也可以考虑与公司进行协商，尝试通过和解或调解的方式解决纠纷。但若协商无果或公司拒绝承认侵占行为，则应及时寻求法律帮助。
- 在整个过程中，股东应保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击等不利于解决问题的行为。
法律背景：
- 职务侵占罪是公司、企业或其他单位工作人员利用职务便利实施的一种常见犯罪类型。其定罪和量刑均受到《中华人民共和国刑法》及相关司法解释的严格规范。
- 在处理此类案件时，法院会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、社会危害程度以及悔罪表现等因素来作出判决。
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