结论前置：工伤二次鉴定为九级，但公司按十级进行赔偿，这种做法通常是不合理的。具体分析如下：

一、工伤鉴定等级与赔偿标准的关系

根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤鉴定等级是确定赔偿标准的重要依据。不同等级的工伤，其赔偿项目和标准存在显著差异。九级工伤和十级工伤在赔偿金额上会有明显区别，九级工伤的赔偿金额通常会高于十级工伤。

二、公司按十级赔偿的合理性分析

1. 不符合法律规定：

   • 工伤鉴定等级是由专业的劳动能力鉴定委员会根据工伤职工的伤情和功能障碍程度进行评定的，具有权威性和法律效力。
   • 公司应当按照工伤鉴定等级对应的赔偿标准进行赔偿，不得擅自降低赔偿等级或标准。

2. 可能损害员工权益：

   • 如果公司按十级赔偿，而实际工伤鉴定等级为九级，那么员工将无法获得应得的赔偿金额，这显然损害了员工的合法权益。
   • 员工有权要求公司按照工伤鉴定等级对应的赔偿标准进行赔偿，并可以通过法律途径维护自己的权益。

三、员工应如何应对

1. 与公司协商：

   • 员工可以首先与公司进行协商，要求公司按照工伤鉴定等级对应的赔偿标准进行赔偿。
   • 在协商过程中，员工可以出示工伤鉴定书和相关法律法规，以支持自己的主张。

2. 申请劳动仲裁或提起诉讼：

   • 如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付应得的赔偿金额。
   • 对劳动仲裁结果不服的，员工还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的权益。

四、赔偿金额的计算（以九级工伤为例）

九级工伤的赔偿项目主要包括一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金以及停工留薪期工资等。具体计算公式如下（以一次性伤残补助金为例）：

• 一次性伤残补助金 = 9个月 × 本人工资

其中，“本人工资”是指工伤职工因工作遭受事故伤害或者患职业病前12个月平均月缴费工资。其他赔偿项目的计算方式也类似，具体标准可能因地区而异。

五、建议与指导

1. 保留相关证据：

   • 员工应妥善保管工伤鉴定书、医疗费用发票、工资单等相关证据，以便在需要时提供证明。

2. 及时咨询专业律师：

   • 如果员工对工伤赔偿问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据员工的具体情况提供专业的法律意见和帮助。

综上所述，工伤二次鉴定为九级，但公司按十级进行赔偿是不合理的。员工有权要求公司按照工伤鉴定等级对应的赔偿标准进行赔偿，并可以通过法律途径维护自己的权益。