核心结论：在行贿行为已超过追诉时效的情况下，暂扣的涉案款原则上应当依法返还，但需结合具体情形判断是否存在例外。以下分情况说明：

1. 若涉案款属于行贿人合法财产

根据《刑事诉讼法》第177条及《刑法》关于追诉时效的规定，若行贿行为已超过法定追诉期限（如行贿罪最高刑为十年以下有期徒刑的，追诉时效为十五年），且无其他犯罪行为需追究刑事责任，则案件应依法终止审理或宣告无罪。此时，暂扣的涉案款作为行贿人合法财产，应当返还给行贿人。
例外情形：若涉案款已被认定为违法所得（如行贿资金来源非法），则可能依据《刑法》第64条被没收上缴国库，即使超过追诉时效也不影响没收程序。

2. 若涉案款属于受贿人违法所得

若暂扣的款项实际是受贿人通过行贿行为获得的财物（如贿赂款），则无论行贿行为是否超过追诉时效，该款项均属于受贿人的违法所得。根据《刑法》第64条，应当依法追缴并上缴国库，不受追诉时效限制。
关键点：需通过证据证明款项性质为受贿所得，而非行贿人合法财产。

3. 若案件涉及其他犯罪或财产混同

若行贿行为虽超过追诉时效，但行贿人或受贿人涉及其他犯罪（如洗钱、贪污等），或涉案款与其他犯罪所得混同，则可能根据《刑事诉讼法》第145条对暂扣款项另行处理（如合并追缴、返还合法部分等）。此时需结合具体案情判断。

4. 程序性要求

无论何种情形，处理暂扣款项均需遵循法定程序：

• 公安机关、检察院或法院应出具正式法律文书（如《解除扣押决定书》《没收决定书》）；
  
• 行贿人或利害关系人有权提出异议或申请复议；
  
• 若款项已被上缴国库，需通过国家赔偿程序主张权利（仅限错误扣押情形）。

建议：若您或相关方涉及此类问题，建议携带案件材料（如扣押清单、生效法律文书等）向我详细咨询，我将结合具体证据和程序节点为您分析款项返还或追缴的合法性及操作路径。