针对您提出的“股东是境外的公司且持有100%股份跑路怎么办”的问题，以下是我的详细解答：
法律关系梳理与初步应对：
- 首先，需要明确的是，即便股东是境外公司，其在中国境内的子公司或投资项目仍需遵守中国的法律法规。股东“跑路”可能涉及多种法律情形，包括但不限于股东失联、股东拒绝履行出资义务、股东抽逃出资等。
- 在初步应对上，建议立即收集并整理所有与股东相关的文件资料，包括但不限于公司章程、股东协议、出资证明、银行转账记录等，以便后续法律行动。
股东失联或拒绝履行义务的处理：
- 股东失联：若股东失联，公司可尝试通过公告、邮件、电话等多种方式联系股东，并保留好联系记录。若长时间无法联系上股东，且股东未履行其出资义务或存在其他违约行为，公司可考虑依据公司章程或股东协议中的相关规定，采取法律手段追究股东责任。
- 股东拒绝履行出资义务：根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，股东有义务按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。若股东拒绝履行出资义务，公司或其他股东可依法向法院提起诉讼，要求股东履行出资义务并承担违约责任。
股东抽逃出资的处理：
- 若股东存在抽逃出资的行为，即在公司成立后，股东未经合法程序而将其已缴纳的出资抽回，这同样违反了《公司法》的规定。公司或其他股东可依法向法院提起诉讼，要求股东返还抽逃的出资，并可能要求其承担赔偿责任。
境外股东的特殊处理：
- 对于境外股东，由于涉及跨国法律适用和司法管辖问题，处理起来可能更为复杂。在必要时，公司可考虑聘请具有国际法律经验的律师或律师事务所，协助处理与境外股东的法律纠纷。
- 同时，公司应关注并遵守中国与境外股东所在国之间的双边或多边投资协定、司法协助条约等国际法律文件，以便在跨国法律纠纷中维护自身权益。
公司解散与清算的考虑：
- 若股东“跑路”导致公司无法继续经营或达到法定解散条件，公司可考虑依法进行解散与清算。在清算过程中，应依法通知所有债权人并公告清算事宜，确保债权人的合法权益得到保障。
预防措施与建议：
- 为避免类似情况再次发生，公司应在未来与股东签订协议时，明确约定股东的权利义务、违约责任及争议解决方式等条款。
- 同时，公司应建立健全的内部治理机制，加强对股东行为的监督和管理，确保公司运营的合法性和稳定性。
总结与建议：面对股东“跑路”的情况，公司应首先保持冷静，依法收集并整理相关证据资料。然后，根据具体情况选择合适的法律手段追究股东责任或维护公司权益。在处理过程中，若涉及跨国法律问题或复杂法律纠纷，建议及时咨询并聘请具有相关经验的律师或律师事务所协助处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。