停薪留职期间退休后死亡，配偶是否有补助需分情况讨论，具体如下：

1. 若停薪留职期间单位仍为其缴纳社保
   根据《社会保险法》第十七条，参加基本养老保险的个人因病或非因工死亡的，其遗属可领取丧葬补助金和抚恤金。因此，若停薪留职期间单位未中断社保缴纳，配偶作为遗属有权向社保机构申领这两项补助。具体标准需参照当地社保政策（如丧葬补助金通常为当地上年度职工月平均工资的若干倍，抚恤金则与缴费年限、退休工资等因素挂钩）。

2. 若停薪留职期间单位未缴纳社保
   若单位未履行社保缴纳义务，导致遗属无法从社保基金获得补助，配偶可依据《劳动合同法》第三十八条、第四十六条，以“未依法缴纳社会保险费”为由，要求单位承担赔偿责任。此时需收集停薪留职协议、工资发放记录、社保缴费记录等证据，证明单位存在过错，进而主张丧葬补助金和抚恤金的替代赔偿。

3. 若停薪留职期间个人以灵活就业身份参保
   若个人自行缴纳了养老保险，死亡后配偶仍可按社保政策申领补助，与单位无关。但若未参保，则无法通过社保途径获得补助，需进一步分析是否存在其他救济途径（如单位福利、商业保险等）。

建议行动步骤：

• 立即联系当地社保局，确认死亡人员社保缴纳状态及补助申领条件；
  
• 若单位未缴社保，收集停薪留职协议、工资流水等证据，向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；
  
• 同步核查是否有单位内部福利政策或商业保险可补充赔偿。
  

如有进一步细节（如停薪留职协议内容、社保缴纳记录等），可随时补充说明，我会为您细化分析。