结论：已过追诉期的刑事案件，单位在内部是否可以不再追究员工责任，这并非一个简单的“可以”或“不可以”的问题，而是需要综合考虑多个因素，包括追诉期的法律含义、单位内部规章制度、员工行为性质以及单位的管理自主权等。以下是对这一问题的详细分析：

1. 追诉期的法律含义：

   • 追诉期，即刑事诉讼的时效期间，是指法律规定的对犯罪嫌疑人或被告人进行刑事追诉的有效期限。超过这个期限，除非存在法定特殊情形（如发现新的证据足以证明原审被告人无罪等），否则一般不再追究刑事责任。
   • 追诉期的设定，旨在保护犯罪嫌疑人或被告人的合法权益，避免因时间过长而导致证据灭失、记忆模糊等问题，从而影响案件的公正审理。

2. 单位内部规章制度：

   • 单位内部是否追究员工责任，首先应依据单位的规章制度。如果单位规章制度中明确规定了对于已过追诉期的刑事案件不再追究员工责任，那么单位可以依据此规定不再追究。
   • 如果单位规章制度中没有明确规定，或者规定与法律法规相冲突，那么单位应依据法律法规来处理。

3. 员工行为性质：

   • 员工的行为性质也是决定单位是否追究责任的重要因素。如果员工的行为严重违反了单位规章制度或法律法规，即使已过追诉期，单位也可能基于内部管理需要或维护单位声誉等考虑，对员工进行一定的处理（如警告、记过、解雇等），但这种处理通常不属于刑事追究。
   • 如果员工的行为轻微或未造成严重后果，且已过追诉期，单位可能更倾向于不再追究员工责任。

4. 单位的管理自主权：

   • 单位在内部管理上享有一定的自主权，包括制定规章制度、对员工进行奖惩等。然而，这种自主权并非无限制的，它必须受到法律法规的约束。
   • 单位在决定是否追究已过追诉期的刑事案件员工责任时，应确保自己的决定不违反法律法规，不侵犯员工的合法权益。

建议：

• 对于单位而言，在处理已过追诉期的刑事案件员工责任问题时，应首先审查自己的规章制度，确保规章制度与法律法规相一致。
• 如果规章制度中没有明确规定，或者规定存在模糊之处，单位应咨询专业律师或法律机构，以获取准确的法律意见。
• 单位在决定是否追究员工责任时，应综合考虑员工行为性质、单位管理需要以及法律法规要求等多个因素，做出合理、公正的决定。

可能后果：

• 如果单位违反法律法规或规章制度，对已过追诉期的刑事案件员工进行不当处理，可能会面临法律纠纷或员工投诉等风险。
• 相反，如果单位能够依法依规处理此类问题，不仅可以维护单位的合法权益和声誉，还可以增强员工的归属感和忠诚度。

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