结论：林业站站长提出扣压两户已迁居农户的省级森林生态效益补偿金是否合法，需根据具体情况判断，一般情况下，若无合法依据，这种扣压行为是不合法的。以下从多个角度进行分析：
一、补偿金的性质与目的
省级森林生态效益补偿金是国家为了保护森林生态，对森林经营者或所有者因保护森林生态而遭受的经济损失给予的补偿。这笔资金具有特定的目的，即用于森林生态的保护和恢复，以及补偿因保护森林而受损的相关利益方。因此，补偿金的发放应当遵循公平、公正、公开的原则，确保资金能够准确、及时地到达符合条件的受益者手中。
二、扣压行为的合法性分析
无合法依据扣压：
- 如果林业站站长在没有法律、法规或政策依据的情况下，擅自扣压已迁居农户的补偿金，这种行为显然是不合法的。农户作为补偿金的合法受益者，有权获得应得的补偿，任何单位或个人都不得非法侵占或扣压。
有合法依据但执行不当：
- 即使存在某些法律、法规或政策规定，允许在特定情况下扣压补偿金（如农户存在违法行为、未履行相关义务等），但林业站站长在执行时也必须严格遵循法定程序和条件。如果站长在执行过程中存在程序违法、条件不符或滥用职权等行为，那么这种扣压行为同样是不合法的。
三、农户的权益保护
了解补偿政策：
- 农户应当主动了解省级森林生态效益补偿金的相关政策，包括补偿标准、发放条件、发放程序等，以便在权益受到侵害时能够及时维权。
保留相关证据：
- 农户在申请补偿金时，应当保留好相关证据，如申请材料、审批文件、发放记录等。这些证据在维权过程中将起到至关重要的作用。
寻求法律援助：
- 如果农户认为自己的权益受到了侵害，可以向当地林业主管部门、政府法制部门或法律援助机构寻求帮助。在必要时，还可以向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
四、对林业站站长的建议
严格依法办事：
- 林业站站长在处理补偿金发放事宜时，应当严格遵守相关法律、法规和政策规定，确保资金的合法、合规发放。
加强沟通与解释：
- 如果因特殊原因需要扣压或暂缓发放补偿金，站长应当及时与农户进行沟通，解释原因并告知相关法律依据和程序。这样可以减少误解和纠纷的发生。
接受监督与检查：
- 林业站站长应当主动接受上级部门和社会各界的监督与检查，确保补偿金发放工作的透明度和公正性。
最后，如果农户遇到林业站站长非法扣压补偿金的情况，应当及时采取措施维护自己的权益。同时，也建议林业站站长在处理此类事宜时能够严格依法办事，确保补偿金的合法、合规发放。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。