结论：企业休探亲假期间，一般情况下不应扣绩效工资，但具体是否扣除需根据用人单位的合法合规制度及劳动合同约定来确定。以下是对这一问题的详细分析：
一、国家法规层面
法律依据：根据《国务院关于职工探亲待遇的规定》第五条，职工在规定的探亲假期和路程假期内，应按照本人的标准工资发给工资。这里的“标准工资”虽通常指基本工资，但结合相关法规精神及实践，应理解为职工在正常出勤情况下应获得的全部劳动报酬，包括绩效工资（除非有特别规定或劳动合同另有约定）。
带薪休假性质：探亲假属于国家法律规定的带薪假期，职工在此期间享有与正常工作相同的工资待遇，这自然包括绩效工资部分。这是因为探亲假是职工依法享有的权利，旨在解决职工与分居两地的配偶或父母团聚的问题，休假期间职工并未失去工作能力或工作业绩的潜在产出。
二、单位规章制度和劳动合同约定
规章制度优先：若单位的规章制度或劳动合同中明确规定，职工休探亲假期间绩效工资不受影响，则单位必须按照此规定执行，不得扣除职工的绩效工资。这是单位对职工权益的保障，也是遵守法律法规的体现。
绩效挂钩的特殊情况：虽然绩效工资通常与工作表现、业绩成果等指标相关联，但若职工休探亲假并未导致其无法完成绩效指标或未对单位造成实际损失，且单位规章制度或劳动合同中未明确规定探亲假期间绩效工资的扣除方式，则单位不得以此为由扣除职工的绩效工资。如果单位有合法合理的依据和明确的规定，比如绩效奖金明确基于考核周期内实际出勤工作天数计算，且这种规定已经过民主程序制定并向劳动者公示，那么在特定情形下可能会对绩效奖金产生一定影响。但这种影响必须基于合法合规的制度规定，且用人单位在制定相关制度时应确保合理性和公平性，不能损害职工的合法权益。
三、实际操作建议
沟通协商：若职工认为单位在其休探亲假期间扣除绩效工资的行为不合理，应首先与单位进行协商沟通，寻求解决方案。在沟通过程中，职工可以明确表达自己的权益和诉求，要求单位出示相关规章制度或劳动合同条款作为依据。
法律途径：协商不成时，职工可以向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。在采取法律途径前，职工应收集好相关证据，如工资条、考勤记录、规章制度等，以便在仲裁或诉讼过程中证明自己的主张。
四、特别提醒
入职时了解制度：建议职工在入职时详细了解企业的规章制度和薪酬体系，特别是关于探亲假和绩效工资的规定。这有助于职工在休探亲假前明确自己的权益和义务，避免后续产生争议。
保留证据：无论是在职期间还是离职后，职工都应保留好与工资、考勤、规章制度等相关的证据。这些证据在维护自身权益时可能起到关键作用。
综上所述，企业休探亲假期间一般不应扣绩效工资，但具体是否扣除需根据用人单位的合法合规制度及劳动合同约定来确定。如有任何疑问或争议，职工可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。