员工微信通知离职在一定条件下是合法的，但为确保离职的合法性和有效性，建议劳动者同时采取更为正式和严谨的书面方式提交离职报告。以下是对此问题的详细分析：
一、微信通知离职的法律效力
一般情况下的法律效力：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同；在试用期内则提前三日通知即可。虽然法律条文明确提到了“书面形式”，但并未明确排除电子数据形式（如微信消息）作为书面形式的替代。
- 如果劳动者通过微信清晰、明确地向用人单位表达了离职意愿，并包含了离职时间等关键信息，且双方对此无异议，那么这样的微信通知通常会被认定为有效的离职通知。例如，“我决定从[具体日期]起正式离职”这样的表述即视为有效。
影响法律效力的特殊情况：
- 主体身份不明确：若微信聊天双方的身份无法清晰证明，如用人单位无法确认发微信的是劳动者本人，或劳动者无法证明接收消息的是有权限的用人单位代表，则离职告知的效力可能受影响。
- 意思表示不清晰：若劳动者在微信中的表述含糊不清，未明确表达离职意愿，或只是提及工作困难、有离职想法而未给出确定时间和决定，则难以认定为有效离职通知。
- 违反特殊程序要求：若法律、法规或用人单位规章制度对离职程序有特殊要求（如需填写离职申请表格并经多级审批），仅通过微信告知可能不符合规定流程，从而影响离职的法律效力。
二、建议与注意事项
建议使用书面形式：
- 尽管微信通知在某些情况下可能具有法律效力，但为确保离职过程的合法性和有效性，建议劳动者采用更为正式和严谨的书面方式提交离职报告。书面报告应明确表达离职意愿、离职时间等关键信息，并加盖个人印章或签字确认。
保留证据：
- 无论采用何种方式告知离职，劳动者都应保留好相关证据，如书面离职报告的副本、公司的签收记录或微信聊天记录截图等。这些证据在发生纠纷时将起到关键作用，有助于维护劳动者的合法权益。
遵守公司规定：
- 在提出离职前，劳动者应了解并遵守用人单位的规章制度中关于离职程序的具体要求。如果公司规定必须通过特定方式（如填写离职申请表）提交离职申请，那么劳动者应遵循这些规定以确保离职过程的顺利进行。
三、特殊情况下的处理
- 如果用人单位与劳动者之间有明确的约定或规定，允许通过微信等电子方式提交离职申请，并且这种约定或规定不违反法律法规的强制性规定，那么微信离职也可能被视为有效。然而，这种情况需要具体根据用人单位的规章制度和双方的约定来判断。
总结来说，员工微信通知离职在一定条件下是合法的，但为确保离职的合法性和有效性，建议劳动者同时采取书面方式提交离职报告，并保留好相关证据以应对可能的纠纷。如果你在离职过程中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。