在调解案件中，砍头息通常是不应被扣除的，因为砍头息本身不受法律保护。以下是对这一问题的详细分析：
一、砍头息的法律性质
砍头息，即在借款时预先扣除的利息，这种做法在法律上通常被视为不合法。根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，借款的利息不得预先在本金中扣除，利息预先在本金中扣除的，应当按照实际借款数额返还借款并计算利息。这意味着，砍头息部分并不被视为合法的借款本金或利息，因此在法律上不应得到支持。
二、调解案件中的处理原则
在调解案件中，双方当事人可以自愿协商达成调解协议。然而，这种协商应当基于合法、公平、公正的原则进行。由于砍头息本身不受法律保护，因此在调解过程中，不应将砍头息作为合法的借款部分进行扣除或计算。如果调解协议中包含了扣除砍头息的内容，该部分内容可能因违反法律规定而无效。
三、实际操作中的建议
明确砍头息的性质：在调解过程中，双方应明确砍头息的性质，即其不受法律保护，不应作为合法的借款部分进行扣除。
依据实际借款数额进行调解：调解应基于实际借款数额进行，即扣除砍头息后的实际借款金额。这样既能保障借款人的合法权益，也能体现调解的公平性和公正性。
咨询专业律师：虽然我在此给出了法律上的分析和建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在调解过程中，如果双方对砍头息的处理存在争议或不确定，建议咨询专业律师以获取更具体的法律指导。不过，既然你已经在向我咨询，我会尽我所能为你提供全面的法律分析和建议。
四、可能的法律后果
如果调解协议中错误地扣除了砍头息，并且该协议被法院确认有效，那么借款人可能需要按照协议履行还款义务，包括支付被错误扣除的砍头息部分。然而，如果借款人能够证明砍头息的存在并主张其不受法律保护，那么法院在审理案件时可能会对调解协议的相关内容进行调整或撤销。
综上所述，在调解案件中，砍头息通常是不应被扣除的。双方应明确砍头息的法律性质，并依据实际借款数额进行调解。如果存在争议或不确定，建议直接向我咨询以获取更具体的法律指导。