在发明权专利侵权纠纷中，当事人确实可以一边向行政机关请求处理，一边提起民事诉讼。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与途径选择
直接提起民事诉讼：
- 法律依据：根据《中华人民共和国专利法》第六十五条的规定，未经专利权人许可，实施其专利即侵犯其专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民法院起诉。
- 适用情况：当事人认为自己的专利权受到侵害时，可以直接向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求侵权人停止侵权行为并赔偿损失。这种方式相对直接，无需经过行政处理程序，可能更快地进入司法程序。
先请求行政机关处理后再诉讼：
- 法律依据：同样依据《中华人民共和国专利法》的相关规定，专利权人或者利害关系人在发现侵权行为后，除了可以直接向法院起诉外，还可以请求管理专利工作的部门（如地方知识产权局）处理。若对管理专利工作的部门的处理决定不服，可以在收到处理通知之日起十五日内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民法院起诉。
- 处理流程：
- 提出请求：专利权人或利害关系人向管理专利工作的部门提交请求书及相关证据材料。
- 调查处理：管理专利工作的部门依法进行调查，认定侵权行为成立的，可责令侵权人立即停止侵权行为等。
- 后续诉讼：若当事人对处理决定不服，可在规定时间内向法院提起行政诉讼。
二、两种途径的比较与选择
时间成本：
- 直接提起民事诉讼可能相对较快，因为无需经过行政处理程序。而先请求行政机关处理后再诉讼，则可能需要经历更长的处理周期，包括行政机关的调查、处理决定以及可能的行政诉讼等。
专业性与效率：
- 行政机关在处理专利侵权纠纷方面具有一定的专业性和经验，能够迅速作出判断并采取相应措施。然而，对于某些复杂或争议较大的案件，直接通过司法程序解决可能更为合适，因为法院能够提供更全面的司法审查和救济。
当事人意愿：
- 最终选择哪种途径还取决于当事人的意愿和实际情况。例如，有些当事人可能更倾向于通过行政程序快速解决问题，尤其是当侵权行为明显且证据充分时。而有些当事人则可能更愿意通过司法程序来维护自己的权益，尤其是当案件涉及复杂的技术问题或法律争议时。
三、法律建议
- 根据案件情况选择途径：当事人应根据案件的具体情况、侵权行为的性质、证据的充分性以及自身的时间成本和风险承受能力等因素来综合考虑选择哪种途径。
- 及时咨询专业律师：在处理专利侵权纠纷时，及时咨询专业律师是非常重要的。律师可以根据案件的具体情况为当事人提供专业的法律建议和策略规划，帮助当事人更好地维护自己的权益。
总结来说，在发明权专利侵权纠纷中，当事人有权选择一边向行政机关请求处理一边提起民事诉讼。这种选择取决于案件的具体情况、当事人的意愿以及时间成本和风险承受能力等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。