结论：事业单位职工连续2年被扣奖金是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断，包括扣奖金的原因、依据以及是否符合相关法律法规和单位规章制度等。以下从多个角度进行分析：

一、合法扣奖金的情形

1. 依据合法有效的规章制度：

   • 如果事业单位有合法有效的规章制度，且该制度明确规定了扣奖金的情形和条件，如职工违反工作纪律、未完成工作任务等，同时该制度已经过民主程序制定并公示或告知职工，那么单位依据该制度扣奖金可能是合法的。
   • 法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。

2. 职工存在过错或违约行为：

   • 如果职工存在严重违反工作纪律、失职、营私舞弊等行为，给单位造成重大损失，或者职工违反与单位签订的劳动合同中的相关约定，单位有权根据合同约定或法律规定扣减奖金。
   • 示例：职工因个人原因导致工作失误，给单位造成经济损失，单位根据内部规定或劳动合同约定扣减其部分奖金作为赔偿。

二、非法扣奖金的情形

1. 无合法依据或违反法律法规：

   • 如果单位扣奖金没有合法依据，如没有明确的规章制度或合同约定，或者扣奖金的行为违反了相关法律法规（如最低工资标准、工资支付规定等），那么该行为可能是非法的。
   • 法律依据：根据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，《工资支付暂行规定》也明确规定了用人单位不得克扣劳动者工资的情形。

2. 扣奖金行为不合理或显失公平：

   • 即使单位有扣奖金的规章制度或合同约定，但如果扣奖金的行为明显不合理或显失公平，如扣奖金的金额过高、扣奖金的原因与职工的实际行为不符等，也可能被认定为非法。
   • 示例：单位以职工未参加一次无关紧要的会议为由，扣减其全年奖金，这种行为可能被视为不合理或显失公平。

三、建议与措施

1. 核实扣奖金的原因和依据：

   • 职工应首先核实单位扣奖金的具体原因和依据，包括是否违反了相关规章制度或合同约定，以及这些规章制度或合同约定是否合法有效。

2. 与单位协商沟通：

   • 如果职工认为单位扣奖金的行为不合法或不合理，可以与单位进行协商沟通，要求单位说明扣奖金的具体原因和依据，并寻求合理的解决方案。

3. 寻求法律援助或投诉举报：

   • 如果协商无果，职工可以向当地的劳动监察部门投诉举报，或者寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

最后，事业单位职工连续2年被扣奖金是否合法，需根据具体情况判断。如果你面临此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。