在农村建房三层以上对外承建时，合同性质的判定主要取决于双方的具体约定以及实际履行情况，但一般来说，更倾向于认定为建设工程施工合同，而非承揽合同。以下从不同角度进行分析：
一、合同性质判定的法律依据
承揽合同与建设工程施工合同的区别：
- 承揽合同：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，承揽合同是承揽人按照定作人的要求完成工作，交付工作成果，定作人支付报酬的合同。承揽合同通常涉及加工、定作、修理、复制、测试、检验等工作。
- 建设工程施工合同：则是指发包方（建设单位）和承包方（施工人）为完成建设工程施工任务而签订的明确双方权利义务的协议。它通常涉及建筑物的建造、安装等工程活动，且往往涉及较大的工程规模和复杂的工程技术。
农村建房三层以上的特殊性：
- 农村建房三层以上，通常涉及较为复杂的建筑技术和安全要求，需要专业的施工队伍和相应的资质。
- 这类工程往往规模较大，涉及多个施工环节和专业技术，与一般的承揽合同（如加工、定作等）有显著区别。
二、合同性质判定的实际考量
合同内容：
- 如果合同中明确约定了施工范围、工程质量标准、工期、价款等建设工程施工合同的关键条款，且承包方具备相应的施工资质，那么该合同更倾向于认定为建设工程施工合同。
- 如果合同内容更侧重于工作成果的交付（如房屋的设计、建造等具体成果），且对施工过程和技术要求描述较少，那么可能更倾向于承揽合同。但在农村建房三层以上的情况下，这种可能性较小。
实际履行情况：
- 如果在实际履行过程中，承包方按照建设工程施工的规范和要求进行施工，使用了专业的施工设备和技术，且工程规模较大，那么该合同更可能被认定为建设工程施工合同。
- 如果承包方只是简单地按照定作人的要求进行建造，没有涉及复杂的施工技术和安全要求，且工程规模较小，那么可能更倾向于承揽合同。但同样，在农村建房三层以上的情况下，这种情况较为罕见。
三、法律建议
明确合同性质：
- 在签订合同时，双方应明确合同性质，是承揽合同还是建设工程施工合同，并明确各自的权利和义务。
- 如果涉及农村建房三层以上的工程，建议签订建设工程施工合同，并明确施工范围、工程质量标准、工期、价款等关键条款。
审查承包方资质：
- 发包方在签订合同时，应审查承包方的施工资质和安全生产条件，确保承包方具备相应的施工能力和安全保障措施。
咨询专业律师：
- 由于合同性质的判定涉及复杂的法律问题和专业技术要求，建议在签订合同前咨询专业律师，以确保合同的合法性和有效性。不过，这一点你已经做到了，因为你现在就在向我咨询！
总结来说，农村建房三层以上对外承建时，合同性质更倾向于认定为建设工程施工合同。双方在签订合同时应明确合同性质和相关条款，并审查承包方的资质和安全生产条件。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。