结论：农业用地承包之后土地性质变更为建设用地，之前的承包合同是否有效需分情况讨论，一般情况下合同部分无效，但特定情形下可能全部无效或有效。
分析如下：
合同部分无效的情形：
- 法律依据：根据《民法典》及相关土地管理法规，土地用途的变更需依法办理审批手续，并符合土地利用总体规划。若农业用地承包后，未经合法程序变更为建设用地，该变更行为违法。
- 合同效力：在此情况下，承包合同中关于农业用地使用的部分，若未违反法律强制性规定，原本有效；但土地性质变更后，原合同中关于土地用途的条款因违法而无效。由于土地用途是承包合同的核心条款之一，其无效可能导致合同部分无效，即合同中与土地用途相关的部分不再具有法律效力，但合同其他部分（如承包期限、承包费用等）若未违反法律，仍可能有效。不过，实践中，土地用途的变更往往会影响合同的整体履行，因此更常见的处理方式是认定合同整体无效或需要重新协商签订新合同。但严格从法律条文出发，可认为合同部分无效。
- 示例：假设甲乙签订农业用地承包合同，约定甲将一块农业用地承包给乙用于种植农作物。后甲未经批准将土地性质变更为建设用地，并欲在此建设厂房。此时，原合同中关于土地用于种植农作物的条款无效，但合同中关于承包期限、承包费用等条款，若未违反法律，理论上仍有效（但实践中可能因土地用途变更导致合同无法继续履行而整体处理）。
合同全部无效的情形：
- 法律依据：若土地性质变更行为不仅违反了土地用途管理规定，还涉及非法转让、倒卖土地使用权等严重违法行为，可能触犯《刑法》相关规定，此时承包合同因违反法律强制性规定而全部无效。
- 合同效力：在此情况下，整个承包合同自始无效，双方需恢复原状，即返还因合同取得的财产，并可能承担赔偿责任。
- 示例：甲乙签订农业用地承包合同后，甲非法将土地转让给丙用于建设，并收取高额转让费。此行为不仅违反了土地用途管理规定，还涉嫌非法转让土地使用权，因此甲乙之间的承包合同全部无效。
合同有效的特殊情形（实践中较少见）：
- 法律依据：若土地性质变更已依法获得批准，并办理了相关手续，且变更后的土地用途与承包合同的目的不冲突（尽管这种情况较为罕见，因为农业用地变更为建设用地通常意味着土地用途的根本性改变），则承包合同可能继续有效，但需根据变更后的土地用途对合同内容进行相应调整。
- 合同效力：在此情况下，合同的有效性取决于变更程序的合法性和合同内容的适应性。若变更程序合法，且合同内容能够适应新的土地用途，则合同继续有效。
- 示例：甲乙签订农业用地承包合同后，因公共利益需要（如修建公路、学校等），政府依法征收了该土地并变更为建设用地。在此情况下，若政府依法给予了补偿，并安排了新的土地供乙继续承包（或提供了其他补偿方式），且甲乙双方就合同变更达成一致，则原承包合同可能继续有效（或经变更后有效）。但这种情况更多涉及合同变更而非合同效力问题。
建议：
- 若您遇到此类情况，建议首先核实土地性质变更是否依法获得批准，并办理了相关手续。
- 若变更行为违法，您可考虑与对方协商解除合同或要求赔偿损失；若协商不成，可向法院提起诉讼。
- 在处理此类纠纷时，务必保留好相关证据（如承包合同、土地性质变更文件、沟通记录等），以便在诉讼中维护自己的合法权益。
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