竣工资料工程款和农民工工资结清证明一般由施工单位（或承包方）出具，但具体出具单位可能因实际情况和合同约定而有所不同。以下是从不同角度进行的详细分析：

1. 施工单位（或承包方）的责任：

   • 在工程建设过程中，施工单位（或承包方）是负责具体施工和支付农民工工资的主体。因此，从逻辑上讲，他们应当是最了解工程款和农民工工资支付情况的一方。
   • 当工程竣工且所有款项（包括工程款和农民工工资）均已结清时，施工单位（或承包方）有义务出具结清证明，以证明其已履行了所有支付义务。

2. 建设单位（或发包方）的参与：

   • 虽然建设单位（或发包方）不是直接支付农民工工资的主体，但他们在工程建设过程中起着监督和管理的作用。
   • 在某些情况下，建设单位（或发包方）可能要求施工单位（或承包方）提供结清证明，作为工程结算和验收的一部分。此外，如果建设单位（或发包方）直接参与了农民工工资的支付（如通过专用账户代发），那么他们也可能需要出具或确认结清证明。

3. 合同约定：

   • 工程建设合同是明确双方权利和义务的重要文件。合同中可能会明确规定结清证明的出具单位、格式和内容等。
   • 因此，在解答这个问题时，还需要仔细审查工程建设合同的相关条款，以确定具体的出具单位。

4. 实际操作中的变通：

   • 在实际操作中，由于各种原因（如合同条款不明确、双方协商不一致等），结清证明的出具单位可能并非严格按照上述规则来确定。
   • 在这种情况下，双方可以通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议，并明确结清证明的出具单位。

建议：

• 如果您是施工单位（或承包方），在工程竣工且所有款项均已结清后，应及时出具结清证明，并加盖公司公章或合同专用章，以确保其法律效力。
• 如果您是建设单位（或发包方），在要求施工单位（或承包方）提供结清证明时，应明确证明的内容、格式和出具时间等要求，并妥善保管好相关证明文件。
• 如果双方在结清证明的出具单位上存在争议，建议通过协商、调解或诉讼等方式来解决，以避免不必要的法律纠纷。

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