结论：在司法赔偿中，法院逾期不予答复之后，并经立案、组织听证程序驳回申请，这一行为是否合法，需结合具体情况及相关法律规定来综合判断。一般情况下，若法院遵循了法定程序，其驳回申请的行为可能是合法的；但若存在程序违法或实体处理不当，则可能不合法。以下从多个角度进行详细分析：
一、法定程序角度
逾期不予答复：
- 根据《中华人民共和国国家赔偿法》及相关司法解释，赔偿请求人向赔偿义务机关提出赔偿申请后，赔偿义务机关应当在规定期限内（通常是两个月）作出是否赔偿的决定。若逾期未予答复，赔偿请求人有权向上一级机关申请复议或直接向法院提起赔偿诉讼。
- 若法院在受理赔偿申请后，未在法定期限内作出答复，这本身可能构成程序违法。但需注意，这里的“逾期”是指法院作为赔偿义务机关时的逾期，而非法院作为审判机关时的逾期。在司法赔偿案件中，法院通常作为审判机关，其“逾期”可能指的是对赔偿申请的审查或立案程序上的延迟，这需结合具体程序规定来判断。
立案与听证程序：
- 法院在受理司法赔偿申请后，会进行立案审查，并可能组织听证程序以查明事实、听取双方意见。
- 立案与听证程序本身需遵循法定规定，如听证通知的送达、听证过程的记录、双方当事人的陈述与辩论权利保障等。若法院在这些程序中存在违法或不当行为，如未依法送达听证通知、未记录听证过程等，则可能影响其后续驳回申请的合法性。
二、实体处理角度
驳回申请的依据：
- 法院驳回司法赔偿申请，需有充分的法律依据和事实依据。这通常包括赔偿请求不符合法定条件、赔偿义务机关的行为不违法或未造成损害、损害与行为之间无因果关系等。
- 若法院驳回申请的依据不充分或存在错误，如错误认定事实、错误适用法律等，则其驳回申请的行为可能不合法。
救济途径：
- 若赔偿请求人对法院驳回申请的决定不服，有权依法提起上诉或申请再审。在上诉或再审过程中，法院会重新审查案件事实与法律适用，并作出新的判决。
- 赔偿请求人应充分利用这些救济途径，以维护自己的合法权益。
三、具体案例分析
- 在实际案例中，法院逾期不予答复后驳回申请的行为是否合法，需结合具体案件事实、程序规定及实体法律来判断。例如，若法院在立案后因故延迟了听证程序的进行，但最终依法组织了听证并充分听取了双方意见，且驳回申请的依据充分、合法，则其行为可能被视为合法。反之，若法院在程序上存在严重违法或不当行为，或驳回申请的依据不充分、错误，则其行为可能不合法。
四、建议
- 对于赔偿请求人而言：若遇到法院逾期不予答复后驳回申请的情况，应首先审查法院的程序是否合法、实体处理是否得当。若认为法院的行为存在违法或不当之处，应及时依法提起上诉或申请再审，以维护自己的合法权益。
- 在提起上诉或申请再审前：建议赔偿请求人咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。
总之，在司法赔偿中，法院逾期不予答复之后并经立案、组织听证程序驳回申请的行为是否合法，需结合具体情况及相关法律规定来综合判断。若您在此方面遇到具体问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。