行政机关在作出行政处罚决定时，通常应自立案之日起九十日内完成，但根据案件复杂程度和法律法规的特殊规定，期限可能有所不同。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般期限规定
基本期限：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政机关应当自立案之日起九十日内作出行政处罚决定。这一期限是为了确保行政效率，同时保障当事人的合法权益。
期限延长：
- 若案情复杂，九十日的期限可能不足。在此情况下，经行政机关负责人批准，可以延长三十日。
- 对于特别复杂或有其他特殊情形的案件，经过延期仍无法作出决定的，需再次经过集体讨论决定是否继续延期，但具体延长的时长需依据案件情况和相关规定确定。
二、特殊类型案件的期限规定
治安管理处罚案件：
- 公安机关办理治安案件的期限，自受理之日起不得超过三十日；案情重大、复杂的，经上一级公安机关批准，可以延长三十日。
- 鉴定期间不计入办案期限，这是为了确保鉴定的准确性和公正性，不受办案期限的限制。
税收行政处罚案件：
- 税务机关对税收违法行为进行调查后，应依法及时作出行政处罚决定。例如，对一般税收违法案件，调查终结后通常应在一定期限内（如15个工作日等，具体因地区和案件情况而异）作出处罚决定。
三、其他影响期限的因素
证据收集和调查的难度：
- 若案件涉及广泛且难以收集的证据，需进行大量调查取证、鉴定、勘验等工作，可能导致作出行政处罚决定的时间延长。
当事人的配合程度：
- 当事人的积极配合有助于加快调查进程，反之则可能增加调查时间，从而延长作出处罚决定的时间。
行政机关的工作效率：
- 不同行政机关的工作流程、人员配备等情况会影响作出行政处罚决定的效率。一些行政机关可能由于内部流程繁琐或人员不足等原因，导致办案期限延长。
四、行政处罚的时效限制
- 行政机关对违法行为的处罚权通常自违法行为发生之日起两年内有效。这意味着，如果违法行为在这两年内没有被发现，之后就不能再对该行为进行行政处罚，除非法律另有特殊规定。例如，涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，追究时效延长至五年。
五、法律建议
对于行政机关：
- 应严格遵守相关法律法规规定的期限和程序要求，确保行政处罚的合法性和有效性。
- 在办案过程中，应注重效率与公正的平衡，避免因期限过长而损害当事人的合法权益。
对于当事人：
- 应积极配合行政机关的调查工作，提供必要的证据和信息，以加快调查进程。
- 若对行政处罚决定有异议，应在法定期限内提出陈述、申辩或申请听证等权利，维护自身的合法权益。
总结来说，行政机关在作出行政处罚决定时，应严格遵守相关法律法规规定的期限和程序要求。同时，当事人也应了解自己的权利和义务，积极配合行政机关的调查工作，并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。