当电动自行车与汽车相撞，且交警部门认定汽车承担次要责任时，关于汽车修车赔偿的问题，我们可以依据相关法律法规来详细解答。
一、责任划分与赔偿原则
责任划分：
- 在此类事故中，责任通常会被划分为主要责任和次要责任。汽车作为次责方，将承担剩余比例的赔偿责任，具体比例由交警根据事故情况确定，但一般来说，次责方承担的比例会低于主责方。
赔偿原则：
- 赔偿将遵循“先交强险，后按责赔偿”的原则。即首先由汽车的交强险在限额内全额赔付，不分责任比例；超出交强险限额的部分，再按照责任比例进行分担。
二、汽车修车赔偿的具体处理
车辆维修费：
- 汽车的维修费用将以实际修复费用为准。您需要保留好正规的修车发票，作为后续理赔的依据。
保险理赔流程：
- 您应立即向自己的保险公司报案，并提交事故责任认定书、修车发票等相关材料。
- 保险公司将根据交强险的限额进行赔付。如果维修费用超出了交强险的财产损失赔偿限额（通常为2000元），那么超出的部分将按照责任比例进行分担。
- 在这个案例中，由于汽车是次责方，所以超出交强险限额的部分，您将需要承担一定比例的赔偿责任。这个比例会根据交警出具的责任认定书来确定。
与电动自行车方的协商：
- 在理赔过程中，您可能需要与电动自行车方进行协商，以确定双方各自应承担的赔偿金额。
- 如果双方对赔偿金额有争议，可以申请交警部门进行调解，或者通过法律途径解决。
三、注意事项
证据留存：
- 请务必保存好所有与事故相关的证据，包括事故责任认定书、修车发票、医疗费用单据（如果有人员受伤）等。这些证据将在后续的理赔过程中起到关键作用。
时效要求：
- 请注意，人身伤害索赔的诉讼时效为三年，财产损失（如车辆维修费）的诉讼时效为两年。因此，请在规定的时间内提出索赔申请。
特殊情形处理：
- 如果电动自行车被认定为机动车但未投保交强险，那么根据相关规定，次责方（即汽车方）可能需要在交强险限额内先行赔付。但这种情况相对较少见，且具体处理方式可能因地区而异。
综上所述，当电动自行车与汽车相撞且汽车承担次要责任时，汽车的修车赔偿将遵循“先交强险，后按责赔偿”的原则。您需要保留好相关证据，及时向保险公司报案并提交理赔材料，同时与电动自行车方进行协商以确定赔偿金额。如有争议，可申请交警部门调解或通过法律途径解决。