结论：使用财务软件查询别公司应付挂账的行为，其合法性取决于查询的方式和目的，且对方公司通常不会直接知道这种查询行为，但非法查询可能面临法律风险。以下从不同角度进行详细分析：

1. 合法性分析：

   • 合法查询：如果你通过合法途径，如与对方公司有业务往来且对方公司同意你查看相关财务记录，或者你作为审计机构、税务机关等依法进行查询，那么这种行为是合法的。在这种情况下，你使用的是对方公司提供的财务数据或公开信息，不涉及侵犯对方公司的隐私或商业秘密。
   • 非法查询：如果你未经对方公司同意，擅自使用财务软件或其他技术手段查询其应付挂账信息，这可能构成非法侵入计算机信息系统或侵犯商业秘密等违法行为。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法侵入计算机信息系统或侵犯商业秘密可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役或罚金等。

2. 对方公司是否会知道：

   • 通常不知道：在合法查询的情况下，对方公司通常会知道你正在查看其财务记录，因为这是基于双方的同意或法律授权。然而，在非法查询的情况下，对方公司通常不会直接知道你的查询行为，除非你留下了明显的痕迹或对方公司采取了相应的安全措施来检测非法访问。
   • 潜在风险：尽管对方公司可能不会直接知道非法查询行为，但一旦被发现，你可能面临法律诉讼和声誉损害等严重后果。此外，非法查询还可能破坏商业信任关系，影响你与对方公司或其他潜在合作伙伴的未来合作。

3. 法律建议：

   • 遵守法律法规：在进行任何财务查询行为时，务必遵守相关法律法规和道德规范。确保你的查询行为是合法的，并尊重对方公司的隐私和商业秘密。
   • 寻求合法途径：如果你需要了解对方公司的财务状况或应付挂账信息，建议通过合法途径进行查询，如与对方公司协商、查阅公开信息或委托专业机构进行审计等。
   • 保护自身权益：如果你发现自己的财务信息被非法查询或泄露，应立即采取措施保护自身权益，包括向相关部门报案、寻求法律援助或采取其他合法手段维护自己的利益。

进一步思考：在商业活动中，诚信和合法性是至关重要的。非法查询对方公司的财务信息不仅可能面临法律风险，还可能损害你的商业声誉和信誉。因此，我建议你始终遵守法律法规和道德规范，通过合法途径获取所需信息，并尊重对方公司的隐私和商业秘密。如果你有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。