非法营运未当场扣车，通常仍会面临行政处罚，处罚方式主要包括罚款，情节严重的还可能面临更严厉的处罚措施。具体分析如下：
罚款：
- 根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条的规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，由县级以上地方人民政府交通运输主管部门责令停止经营。
- 有违法所得的，没收违法所得，并处违法所得2倍以上10倍以下的罚款。
- 若违法所得不足2万元，则处3万元以上10万元以下的罚款。这是非法营运行为最常见的处罚方式，无论是否当场扣车，只要查实非法营运行为，均可依法作出罚款决定。
其他处罚措施：
- 责令改正：交通运输主管部门会责令非法营运者立即停止违法行为，这是对其非法行为的直接纠正。
- 扣押车辆（后续执行）：虽然问题中提到未当场扣车，但并不意味着后续不会扣押。如果非法营运者拒不执行停止经营的决定，或者存在其他严重情节，交通运输主管部门有权依法扣押涉案车辆，以强制其停止违法行为。
- 构成犯罪的追究刑事责任：如果非法营运行为情节严重，构成犯罪的，如非法经营罪，将依法追究刑事责任。这通常涉及更严重的违法行为，如大规模、长期性的非法营运，或者造成严重后果的。
处罚的考量因素：
- 违法情节的轻重：包括非法营运的规模、持续时间、是否造成危害后果等。
- 是否配合调查：非法营运者是否积极配合交通运输主管部门的调查，如实提供相关证据和信息。
- 是否有前科：非法营运者是否曾因类似行为受过行政处罚或刑事处罚。
行动建议：
- 立即停止非法营运行为：避免进一步违法，减少可能的损失和风险。
- 配合调查：如果接到交通运输主管部门的调查通知，应积极配合，如实提供相关证据和信息。
- 寻求法律帮助：如果对处罚决定有异议，或者需要了解更详细的法律信息和应对策略，可以直接向我咨询。