结论：业务提成用运费借支是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果您与公司签订的劳动合同或提成协议中明确规定了业务提成的支付方式，且未提及可以用运费借支的方式支付，那么公司擅自以运费借支的方式支付业务提成可能构成违约。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。因此，公司应按照合同约定的方式支付业务提成。

2. 财务与税务合规角度：

   • 从财务和税务的角度来看，业务提成和运费是两种性质不同的费用。业务提成通常属于劳动报酬的一部分，应计入工资薪金所得，并依法缴纳个人所得税。而运费则是与货物运输相关的费用，通常计入企业的运营成本。如果公司将业务提成以运费的形式借支，可能会涉及财务造假和偷逃税款的问题，这是违法的。根据《中华人民共和国税收征收管理法》的规定，纳税人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款，不得偷税、逃税。

3. 实际操作与风险角度：

   • 即使公司出于某种原因（如资金周转困难）希望以运费借支的方式支付业务提成，也应与员工进行充分沟通，并确保这种支付方式不会违反相关法律法规和合同约定。同时，公司应考虑到这种支付方式可能带来的税务风险和法律风险，以及可能对员工造成的负面影响（如影响员工的个人所得税申报和缴纳等）。

建议：

• 如果您发现公司以运费借支的方式支付业务提成，且您认为这种方式存在问题或风险，建议您首先与公司进行沟通，了解公司的具体意图和操作方式，并表达您的担忧和诉求。
• 如果沟通无果或您认为公司的行为已经构成违法或违约，您可以考虑向当地的劳动监察部门或税务部门进行投诉或举报，以维护自己的合法权益。
• 在处理此类问题时，建议您保留好相关的证据材料（如劳动合同、提成协议、支付记录等），以便在需要时提供证明。

可能后果：

• 如果公司的行为被认定为违法或违约，可能会面临劳动监察部门的处罚或税务部门的追缴税款和罚款等后果。
• 同时，公司的行为也可能对员工的权益造成损害，如影响员工的个人所得税申报和缴纳、导致员工无法及时获得应得的业务提成等。因此，员工有权要求公司纠正错误行为并赔偿损失。